More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0144 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0144  thiamine-phosphate diphosphorylase  100 
 
 
218 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1935  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.46 
 
 
612 aa  177  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.77 
 
 
479 aa  175  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00801461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0283  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.09 
 
 
212 aa  174  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513591 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  46.24 
 
 
479 aa  174  9e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0346  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.91 
 
 
224 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0454  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.91 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3854  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.91 
 
 
215 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3716  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.8 
 
 
211 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0463908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1526  hypothetical protein  46.02 
 
 
488 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1457  hypothetical protein  46.02 
 
 
488 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3871  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.37 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0361  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.38 
 
 
500 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.5 
 
 
211 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.19 
 
 
211 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.262167 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4484  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.19 
 
 
211 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4227  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.63 
 
 
211 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4569  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.07 
 
 
211 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03870  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.89 
 
 
211 aa  158  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03823  hypothetical protein  46.89 
 
 
211 aa  158  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0206  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.19 
 
 
211 aa  158  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0267078 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4032  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.89 
 
 
211 aa  158  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4535  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.89 
 
 
211 aa  158  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4373  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.51 
 
 
211 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0254  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase  40.61 
 
 
529 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.07 
 
 
211 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0042  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.63 
 
 
214 aa  156  2e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.81 
 
 
513 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0637429  normal  0.579661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0219  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.69 
 
 
213 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.51 
 
 
211 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  hitchhiker  0.0000191197 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4001  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.33 
 
 
211 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0215  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.13 
 
 
213 aa  155  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4493  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.51 
 
 
211 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0244501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0023  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.65 
 
 
213 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.564168  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0208  thiamine monophosphate synthase  39.9 
 
 
349 aa  151  7e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.287057  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00145  Thiamine monophosphate synthase  41.24 
 
 
526 aa  151  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2163  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.61 
 
 
201 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.460146  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.57 
 
 
215 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00365  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.86 
 
 
471 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0893  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.68 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.401641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0386  putative thiamin-phosphate pyrophosphorylase, ThiE  40.67 
 
 
367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.57 
 
 
560 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2727  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  39.7 
 
 
216 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002073  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  36.44 
 
 
471 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2096  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.24 
 
 
565 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3678  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.7 
 
 
367 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3227  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.7 
 
 
367 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3705  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.7 
 
 
367 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.7 
 
 
367 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1882  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.24 
 
 
565 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2777  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.7 
 
 
367 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3736  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.7 
 
 
367 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2451  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.25 
 
 
440 aa  141  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2382  phosphomethylpyrimidine kinase  40.78 
 
 
530 aa  141  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2014  phosphomethylpyrimidine kinase, thiamine-phosphate diphosphorylase  41.34 
 
 
557 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1771  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.3 
 
 
613 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0340  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.11 
 
 
374 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.502306  normal  0.460006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2444  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase, putative  42.31 
 
 
526 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2591  phosphomethylpyrimidine kinase  41.21 
 
 
535 aa  138  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0347459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1417  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.24 
 
 
208 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0012  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.62 
 
 
202 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170597  normal  0.127003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3005  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  39.44 
 
 
364 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0331  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.56 
 
 
374 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1923  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.38 
 
 
637 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.77 
 
 
375 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0316  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.37 
 
 
371 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416769  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0892  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.36 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000295383  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2438  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
632 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2322  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
632 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.756854  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2694  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.17 
 
 
375 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0413  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.17 
 
 
375 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232959  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2984  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.04 
 
 
226 aa  131  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2025  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.81 
 
 
650 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308953 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2023  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.81 
 
 
650 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2467  thiamine-phosphate diphosphorylase  39.57 
 
 
312 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2163  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.55 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507656  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0038  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.29 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539865  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2771  thiamine-phosphate diphosphorylase  40.21 
 
 
375 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207667  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2565  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.29 
 
 
206 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.795825  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2894  thiamine-phosphate diphosphorylase  38.33 
 
 
208 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.511972  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0442  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.8 
 
 
201 aa  128  6e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0214  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
203 aa  128  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0911  thiamine-phosphate diphosphorylase  36.36 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.307572  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3653  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.93 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5922  thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  36.57 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.581006  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3511  thiamine-phosphate diphosphorylase  41.57 
 
 
374 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155888  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3322  thiamine monophosphate synthase  37.04 
 
 
384 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2467  thiamine monophosphate synthase  37.78 
 
 
214 aa  126  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571514  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
581 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3572  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.05 
 
 
367 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480222  hitchhiker  0.0000254394 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0205  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.93 
 
 
203 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3646  thiamine monophosphate synthase  37.04 
 
 
384 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4095  Thiamine-phosphate diphosphorylase  37.43 
 
 
202 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000665873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1859  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamine-phosphate diphosphorylase  38.67 
 
 
525 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0281  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.59 
 
 
209 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3290  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.32 
 
 
307 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6225  thiamine phosphate pyrophosphorylase  36.67 
 
 
202 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0618316  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1606  phosphomethylpyrimidine kinase / thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.21 
 
 
532 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.41103  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2200  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.6 
 
 
559 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4170  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.97 
 
 
201 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  0.52609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>