More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2565 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2565  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
206 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.795825  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4170  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  72.59 
 
 
201 aa  305  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  0.52609 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5922  thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  67.82 
 
 
203 aa  296  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.581006  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0281  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  65.5 
 
 
209 aa  285  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0214  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  66.15 
 
 
203 aa  276  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0205  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  65.64 
 
 
203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0442  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60.2 
 
 
201 aa  266  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2163  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  64.1 
 
 
201 aa  260  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.460146  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0911  thiamine-phosphate diphosphorylase  61.66 
 
 
199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.307572  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3653  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60.91 
 
 
198 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1417  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  66.67 
 
 
208 aa  248  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0038  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  58.59 
 
 
198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539865  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6225  thiamine phosphate pyrophosphorylase  54.64 
 
 
202 aa  220  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0618316  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2163  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.55 
 
 
202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507656  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3431  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.33 
 
 
202 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1955  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.82 
 
 
202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2467  thiamine monophosphate synthase  52.6 
 
 
214 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571514  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4095  Thiamine-phosphate diphosphorylase  53.33 
 
 
202 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000665873  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2894  thiamine-phosphate diphosphorylase  52.08 
 
 
208 aa  207  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.511972  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0012  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.37 
 
 
202 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170597  normal  0.127003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.22 
 
 
513 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0637429  normal  0.579661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.19 
 
 
215 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0206  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.69 
 
 
211 aa  175  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0267078 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0346  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.7 
 
 
224 aa  174  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3854  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.7 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0454  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.19 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.67 
 
 
211 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.37 
 
 
211 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  hitchhiker  0.0000191197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4493  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.37 
 
 
211 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0244501 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4373  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.89 
 
 
211 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0023  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.21 
 
 
213 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.564168  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4569  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.84 
 
 
211 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03870  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.32 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03823  hypothetical protein  46.32 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4484  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.32 
 
 
211 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4535  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.32 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4032  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.32 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913543 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1526  hypothetical protein  43.92 
 
 
488 aa  165  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4227  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.32 
 
 
211 aa  165  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0283  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.32 
 
 
212 aa  165  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513591 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  42.63 
 
 
479 aa  164  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.79 
 
 
211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.262167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00145  Thiamine monophosphate synthase  45.3 
 
 
526 aa  164  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.79 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235463 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.11 
 
 
479 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00801461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4001  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.79 
 
 
211 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0215  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.96 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3871  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.67 
 
 
211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1457  hypothetical protein  43.39 
 
 
488 aa  162  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0219  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.95 
 
 
213 aa  159  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1935  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.71 
 
 
612 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0893  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.54 
 
 
244 aa  158  7e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.401641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2727  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  45.81 
 
 
216 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3716  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.62 
 
 
211 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0463908  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3705  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.81 
 
 
367 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3227  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.81 
 
 
367 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.81 
 
 
367 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2777  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.81 
 
 
367 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3678  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.81 
 
 
367 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3736  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.02 
 
 
367 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0340  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.04 
 
 
374 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.502306  normal  0.460006 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0208  thiamine monophosphate synthase  39.7 
 
 
349 aa  154  6e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.287057  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0361  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.31 
 
 
500 aa  154  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0386  putative thiamin-phosphate pyrophosphorylase, ThiE  45.9 
 
 
367 aa  154  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2984  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.55 
 
 
226 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0331  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.49 
 
 
374 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0254  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase  43.02 
 
 
529 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0892  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.05 
 
 
308 aa  151  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000295383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002073  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  38.65 
 
 
471 aa  151  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0042  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.12 
 
 
214 aa  150  1e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3005  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  43.58 
 
 
364 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00365  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.68 
 
 
471 aa  148  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3290  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.62 
 
 
307 aa  147  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2444  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase, putative  46.15 
 
 
526 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2451  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
440 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1882  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.78 
 
 
565 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2096  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.25 
 
 
565 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.19 
 
 
375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0316  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.99 
 
 
371 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416769  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2771  thiamine-phosphate diphosphorylase  46.63 
 
 
375 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207667  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3511  thiamine-phosphate diphosphorylase  47.59 
 
 
374 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155888  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.56 
 
 
560 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3071  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.86 
 
 
302 aa  141  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047455  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2694  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.99 
 
 
375 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0413  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.99 
 
 
375 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232959  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2467  thiamine-phosphate diphosphorylase  39.01 
 
 
312 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0209  thiamine-phosphate diphosphorylase  44.32 
 
 
378 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2014  phosphomethylpyrimidine kinase, thiamine-phosphate diphosphorylase  40.33 
 
 
557 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47293  predicted protein  39.51 
 
 
580 aa  136  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4311  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.46 
 
 
314 aa  135  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411869  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.58 
 
 
309 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3572  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.55 
 
 
367 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480222  hitchhiker  0.0000254394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1606  phosphomethylpyrimidine kinase / thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.7 
 
 
532 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.41103  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0108  thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  39.6 
 
 
383 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.18 
 
 
309 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0144  thiamine-phosphate diphosphorylase  37.29 
 
 
218 aa  129  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0166  thiamine monophosphate synthase  41.05 
 
 
376 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1939  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.18 
 
 
309 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.850438  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3646  thiamine monophosphate synthase  40.64 
 
 
384 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2591  phosphomethylpyrimidine kinase  38.5 
 
 
535 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0347459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>