More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1606 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1606  phosphomethylpyrimidine kinase / thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
532 aa  1022    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.41103  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2434  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  49.66 
 
 
613 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.527798 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.77 
 
 
479 aa  278  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00801461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  36.19 
 
 
479 aa  278  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1457  hypothetical protein  34.38 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1526  hypothetical protein  34.38 
 
 
488 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2444  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase, putative  39.02 
 
 
526 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2096  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.98 
 
 
565 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1882  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.45 
 
 
565 aa  256  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.43 
 
 
560 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.08 
 
 
513 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0637429  normal  0.579661 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2382  phosphomethylpyrimidine kinase  34.97 
 
 
530 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2591  phosphomethylpyrimidine kinase  34.53 
 
 
535 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0347459 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2200  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.35 
 
 
559 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0254  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase  33.91 
 
 
529 aa  240  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0361  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.4 
 
 
500 aa  238  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  34.95 
 
 
581 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2014  phosphomethylpyrimidine kinase, thiamine-phosphate diphosphorylase  34.72 
 
 
557 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2023  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.67 
 
 
650 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1923  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
637 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2438  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.83 
 
 
632 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2322  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.83 
 
 
632 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.756854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00145  Thiamine monophosphate synthase  31.3 
 
 
526 aa  221  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1859  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamine-phosphate diphosphorylase  37.15 
 
 
525 aa  220  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2025  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.24 
 
 
650 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308953 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1771  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.07 
 
 
613 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47293  predicted protein  33.4 
 
 
580 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 
285 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  32.7 
 
 
478 aa  156  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 
264 aa  153  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1935  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43 
 
 
612 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  33.07 
 
 
272 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
264 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  35.63 
 
 
270 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  35.77 
 
 
262 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  32.57 
 
 
264 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  32.7 
 
 
273 aa  146  8.000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
265 aa  145  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 
269 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  38.58 
 
 
288 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  38.61 
 
 
268 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  31.8 
 
 
264 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  35.38 
 
 
279 aa  144  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  32.06 
 
 
276 aa  143  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  32.06 
 
 
276 aa  143  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  32.84 
 
 
270 aa  143  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  32.94 
 
 
267 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  35.02 
 
 
267 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2379  phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 
263 aa  141  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17679 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  36.23 
 
 
277 aa  141  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  38.1 
 
 
288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  38.1 
 
 
288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  35.63 
 
 
436 aa  140  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  37.92 
 
 
271 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
268 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  41.42 
 
 
270 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  38.66 
 
 
266 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 
261 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  34.34 
 
 
290 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0023  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.65 
 
 
213 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.564168  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3871  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.2 
 
 
211 aa  137  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  38.13 
 
 
266 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  36.74 
 
 
286 aa  136  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  37.74 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 
261 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  37.79 
 
 
264 aa  136  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  38.36 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  38.36 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  37.74 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  37.74 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  38.36 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  38.72 
 
 
284 aa  136  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  37.74 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2451  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.49 
 
 
440 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  37.74 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  37.74 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  38.36 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  37.74 
 
 
266 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  39.25 
 
 
282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 
268 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.65 
 
 
215 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  40.15 
 
 
268 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  39.25 
 
 
282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  40.53 
 
 
268 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  37.74 
 
 
266 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  39.25 
 
 
282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 
260 aa  135  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 
261 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  37.9 
 
 
266 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0893  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.19 
 
 
244 aa  134  5e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.401641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2565  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.7 
 
 
206 aa  133  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.795825  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0208  thiamine monophosphate synthase  27.24 
 
 
349 aa  133  7.999999999999999e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.287057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  36.05 
 
 
266 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 
271 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  30.45 
 
 
264 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  36.63 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  36.26 
 
 
295 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  37.19 
 
 
490 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  36.33 
 
 
266 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>