More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47293 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47293  predicted protein  100 
 
 
580 aa  1198    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  34.66 
 
 
479 aa  281  3e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.47 
 
 
479 aa  279  9e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00801461  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1457  hypothetical protein  32.61 
 
 
488 aa  276  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1526  hypothetical protein  32.43 
 
 
488 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.69 
 
 
513 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0637429  normal  0.579661 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2014  phosphomethylpyrimidine kinase, thiamine-phosphate diphosphorylase  35.97 
 
 
557 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2096  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.85 
 
 
565 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2382  phosphomethylpyrimidine kinase  36.12 
 
 
530 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1882  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.4 
 
 
565 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2591  phosphomethylpyrimidine kinase  34.14 
 
 
535 aa  249  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0347459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2444  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase, putative  37.68 
 
 
526 aa  247  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.63 
 
 
560 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1923  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.91 
 
 
637 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2200  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.43 
 
 
559 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1859  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamine-phosphate diphosphorylase  35.58 
 
 
525 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2023  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.47 
 
 
650 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2025  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.61 
 
 
650 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308953 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2322  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
632 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.756854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2438  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
632 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1606  phosphomethylpyrimidine kinase / thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.4 
 
 
532 aa  234  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.41103  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0254  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase  30.64 
 
 
529 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1771  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.06 
 
 
613 aa  223  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0361  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.02 
 
 
500 aa  223  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00145  Thiamine monophosphate synthase  30.66 
 
 
526 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  32.51 
 
 
581 aa  206  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  38.54 
 
 
288 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  38.14 
 
 
264 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  37.8 
 
 
264 aa  183  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  38.51 
 
 
260 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  43.03 
 
 
266 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  37.9 
 
 
288 aa  179  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  37.9 
 
 
288 aa  179  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  38.54 
 
 
266 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  33.02 
 
 
478 aa  177  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  39.49 
 
 
285 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  36.86 
 
 
270 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 
268 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  35.93 
 
 
265 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  37.99 
 
 
271 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  40.13 
 
 
269 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  38.7 
 
 
267 aa  171  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  37.41 
 
 
260 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  36.56 
 
 
264 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2434  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  27.85 
 
 
613 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.527798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  38.1 
 
 
270 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  37.74 
 
 
268 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  38.6 
 
 
297 aa  166  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  36.36 
 
 
262 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  38.89 
 
 
269 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  39.24 
 
 
280 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  41.77 
 
 
269 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  39.86 
 
 
269 aa  165  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  37.62 
 
 
268 aa  165  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  39.13 
 
 
265 aa  163  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  38.02 
 
 
268 aa  163  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 
268 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  38.21 
 
 
271 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  42.58 
 
 
531 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  39.86 
 
 
282 aa  161  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  37.34 
 
 
273 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  36.62 
 
 
277 aa  160  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  37.16 
 
 
283 aa  160  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  34.67 
 
 
270 aa  159  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  38.24 
 
 
284 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  39.68 
 
 
308 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2054  phosphomethylpyrimidine kinase  42.7 
 
 
268 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  36.68 
 
 
285 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  34.47 
 
 
272 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  32.01 
 
 
273 aa  158  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  33.44 
 
 
267 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  37.58 
 
 
285 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  35.43 
 
 
290 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  37.62 
 
 
297 aa  157  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0362  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
259 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  37.46 
 
 
285 aa  156  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  43.43 
 
 
303 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2688  phosphomethylpyrimidine kinase  44.35 
 
 
275 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  36.39 
 
 
270 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  34.22 
 
 
449 aa  155  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 
267 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00130  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  34.78 
 
 
561 aa  154  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  39.33 
 
 
267 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  45.02 
 
 
303 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
263 aa  154  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0699  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 
269 aa  154  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  41.85 
 
 
290 aa  154  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 
281 aa  154  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  39.54 
 
 
272 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  35.12 
 
 
264 aa  154  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  34.05 
 
 
260 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  35.71 
 
 
269 aa  153  7e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  34.81 
 
 
270 aa  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  34.59 
 
 
278 aa  153  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  34.81 
 
 
270 aa  153  8e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  35.03 
 
 
268 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  39.12 
 
 
492 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 
267 aa  153  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  36.7 
 
 
499 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  35 
 
 
265 aa  152  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>