More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0554 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0181  phosphomethylpyrimidine kinase  80.73 
 
 
287 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0724  phosphomethylpyrimidine kinase  81.45 
 
 
278 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0974702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10427  phosphomethylpyrimidine kinase  74.24 
 
 
265 aa  358  7e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.206949  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  65.47 
 
 
280 aa  353  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  70.21 
 
 
290 aa  346  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.254816  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3738  phosphomethylpyrimidine kinase  65.82 
 
 
295 aa  293  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773086  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34580  phosphomethylpyrimidine kinase  59.34 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  55.64 
 
 
268 aa  281  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0424  phosphomethylpyrimidine kinase  58.96 
 
 
276 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  54.55 
 
 
263 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  53.26 
 
 
268 aa  230  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3441  phosphomethylpyrimidine kinase  55.09 
 
 
268 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.907993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 
262 aa  225  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
264 aa  221  9e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
436 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 
285 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  56.52 
 
 
273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8032  phosphomethylpyrimidine kinase  54.48 
 
 
290 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  48.22 
 
 
264 aa  209  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3612  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 
277 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  49.21 
 
 
269 aa  206  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 
268 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 
268 aa  205  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  46.21 
 
 
490 aa  202  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  43.14 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 
267 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  44.88 
 
 
267 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 
278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  43.14 
 
 
270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8003  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 
285 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 
497 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 
270 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 
268 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  46.47 
 
 
266 aa  195  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 
268 aa  195  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  39.47 
 
 
279 aa  195  8.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 
270 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 
270 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 
270 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 
270 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  39.15 
 
 
264 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 
273 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  47.24 
 
 
266 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  40.31 
 
 
273 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  41.96 
 
 
270 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  45.91 
 
 
264 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  37.98 
 
 
264 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 
264 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 
261 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  43.14 
 
 
444 aa  188  8e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
450 aa  188  9e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  46.64 
 
 
484 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 
261 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  42.06 
 
 
260 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 
261 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  46.25 
 
 
484 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  38.52 
 
 
274 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  38.52 
 
 
274 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  38.52 
 
 
274 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  38.52 
 
 
274 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  45.32 
 
 
271 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  38.52 
 
 
274 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  43.17 
 
 
275 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  38.13 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  38.13 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  38.13 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  38.13 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  38.13 
 
 
274 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 
323 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  41.95 
 
 
288 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  41.95 
 
 
288 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 
267 aa  182  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
272 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  43.31 
 
 
497 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  46.27 
 
 
269 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 
284 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
260 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  38.37 
 
 
270 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  42.13 
 
 
266 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  41.2 
 
 
288 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.94 
 
 
270 aa  180  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 
286 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1368  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  35.8 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 
266 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>