More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2379 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2379  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 263 aa  520  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  63.36 
 
 		 279 aa  298  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  58.17 
 
 		 278 aa  292  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  59.39 
 
 		 271 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  60.08 
 
 		 274 aa  288  5.0000000000000004e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  60.84 
 
 		 275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04031  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.278475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0362  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 285 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  46.27 
 
 		 260 aa  214  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03941  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03951  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.941064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 270 aa  208  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 270 aa  208  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 450 aa  206  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  39.62 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  41.22 
 
 		 270 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  41.22 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  47.84 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  46.03 
 
 		 444 aa  202  4e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  40.84 
 
 		 270 aa  201  7e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 		 264 aa  201  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1765  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.962126  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  39.69 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  46.4 
 
 		 449 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 270 aa  199  6e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 		 436 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  46.25 
 
 		 449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  40.61 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 268 aa  191  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  45.17 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  42.52 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  44.14 
 
 		 271 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 		 269 aa  184  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 		 277 aa  185  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  45.27 
 
 		 497 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  35.91 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 		 264 aa  181  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 		 272 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  48.13 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  40.28 
 
 		 510 aa  180  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  47.84 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  46.24 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  48.5 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  43.28 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 490 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  40.23 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  40.61 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  42.06 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  40.61 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  40.61 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  40.23 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  40.23 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  40.23 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  40.23 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  40.23 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  40.23 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  47.19 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  40.23 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>