More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3401 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 270 aa  521  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  42.48 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  41.02 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  42.25 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  48.3 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  41.64 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  43.35 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2379  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  38.02 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  45.28 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  34.57 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  40.74 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  40.74 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  45.28 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  39.53 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  36.06 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  36.06 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0368  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  41.51 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 		 436 aa  156  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0957  phosphomethylpyrimidine kinase  38.78 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.297451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  41.31 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  45.66 
 
 		 301 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  31.1 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  40.64 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  48.13 
 
 		 276 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  36.36 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  41.09 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  35.82 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 		 497 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  40.44 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  35.96 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  38.13 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  38.85 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  35.02 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  37.69 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 		 448 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  36.82 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  37.31 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  40.45 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  37.31 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  37.31 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  37.31 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  37.31 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  37.31 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 		 283 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 		 284 aa  148  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  37.31 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  37.31 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  37.16 
 
 		 277 aa  148  9e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4275  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.096784  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  32.22 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  32.81 
 
 		 444 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  42.25 
 
 		 484 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  35.66 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  34.12 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  41.31 
 
 		 450 aa  146  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  38.08 
 
 		 266 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  38.37 
 
 		 269 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  34.88 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  35.55 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  39.48 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  34.7 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  42.52 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0817  phosphomethylpyrimidine kinase  36.9 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.237614  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 		 449 aa  146  5e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  38.26 
 
 		 492 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>