More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0629 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  100 
 
 
290 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  47.23 
 
 
279 aa  221  9e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 
265 aa  215  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
271 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
265 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
271 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 
269 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
274 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  42.81 
 
 
281 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 
265 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 
265 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 
265 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  47.73 
 
 
265 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  44.92 
 
 
262 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 
265 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 
253 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  40.93 
 
 
285 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3302  phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 
276 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 
268 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 
288 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 
288 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 
277 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  43.4 
 
 
277 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  40.31 
 
 
268 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
268 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  37.4 
 
 
277 aa  149  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  40.45 
 
 
270 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  37.55 
 
 
260 aa  148  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  39.18 
 
 
264 aa  148  9e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  40.16 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
269 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  37.55 
 
 
271 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  41.77 
 
 
270 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  35.66 
 
 
267 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  41.28 
 
 
271 aa  142  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  37.34 
 
 
266 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  38.08 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  38.37 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  39.59 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  40.39 
 
 
271 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  37.7 
 
 
275 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  36.63 
 
 
266 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  36.25 
 
 
262 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 
271 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0818  phosphomethylpyrimidine kinase  42.39 
 
 
272 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0656179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  39.01 
 
 
270 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  39.01 
 
 
270 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  39.01 
 
 
270 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  39.45 
 
 
497 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  39.01 
 
 
270 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  40.26 
 
 
268 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  39.01 
 
 
270 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  34.14 
 
 
265 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  33.06 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  38.65 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  35.61 
 
 
269 aa  136  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
269 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  37.39 
 
 
273 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  35.61 
 
 
269 aa  135  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1501  phosphomethylpyrimidine kinase  36.95 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  38.62 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  30.77 
 
 
432 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  39 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  34.12 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  38.96 
 
 
270 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  33.96 
 
 
290 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  38.12 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  38.33 
 
 
490 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  35.22 
 
 
267 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 
260 aa  132  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  36.95 
 
 
497 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  39.75 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  36.26 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  42.26 
 
 
269 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  38.58 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  36.13 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  37.94 
 
 
264 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  35.71 
 
 
270 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  38.25 
 
 
266 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  39.49 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  40.33 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  39.33 
 
 
484 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  36.47 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  36.86 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  38.49 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  35.95 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  35.71 
 
 
270 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  35.95 
 
 
267 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  30.24 
 
 
269 aa  129  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  39.22 
 
 
272 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 
484 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  43.54 
 
 
274 aa  128  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  37.96 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>