More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2903 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  100 
 
 
277 aa  551  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
277 aa  551  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 
281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  46.32 
 
 
285 aa  218  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  47.96 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 
279 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
262 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  51.17 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 
265 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  50.98 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 
271 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
265 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  47.84 
 
 
265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  48.62 
 
 
271 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  43.4 
 
 
290 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  47.84 
 
 
265 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 
260 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  44.8 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  44.54 
 
 
266 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 
285 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  40.87 
 
 
260 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  45.57 
 
 
270 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
266 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  39.29 
 
 
253 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  38.1 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 
270 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 
270 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 
270 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 
270 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 
270 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3814  putative hydroxymethylpyrimidine kinase  37.93 
 
 
286 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00579021  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  35.41 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  41.85 
 
 
484 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  33.95 
 
 
270 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  38.1 
 
 
260 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
273 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  35.48 
 
 
264 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  38.31 
 
 
270 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 
271 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  39.54 
 
 
270 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  37.4 
 
 
449 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  39.16 
 
 
270 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0379  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  40.3 
 
 
288 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0861  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  40.3 
 
 
288 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  40.49 
 
 
259 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0832  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  40.3 
 
 
288 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00416098  hitchhiker  0.0000421628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  38.25 
 
 
262 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  34.73 
 
 
267 aa  148  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3959  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase-like  39.93 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.112165 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  40.74 
 
 
484 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  41 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  38.78 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0751  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  39.55 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.490476  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 
497 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  38.78 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0734  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  39.55 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  41.34 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2527  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  40.23 
 
 
323 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0489617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  40.61 
 
 
268 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  32.08 
 
 
267 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2743  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  39.7 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.531156  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2000  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  39.7 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3152  putative phosphomethylpyrimidine kinase  39.7 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3174  hydroxymethylpyrimidine kinase  39.7 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.262803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3116  putative phosphomethylpyrimidine kinase  39.7 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1459  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  39.7 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  41.53 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  44.21 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0913  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  39.7 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1862  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  39.7 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  38.7 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  35.22 
 
 
257 aa  145  9e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  42.41 
 
 
268 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  38.04 
 
 
270 aa  143  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  41.13 
 
 
284 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
288 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
288 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  33.09 
 
 
276 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  39.18 
 
 
270 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  33.09 
 
 
276 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34580  phosphomethylpyrimidine kinase  42.49 
 
 
279 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0865  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.31 
 
 
286 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00118659  normal  0.187037 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  35.36 
 
 
268 aa  142  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  35.96 
 
 
290 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  34.72 
 
 
264 aa  141  9e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  40.16 
 
 
490 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  39.7 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  40.4 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3672  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 
284 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.676544  normal  0.238942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>