More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1513 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  58.21 
 
 
269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  48.07 
 
 
281 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  47.97 
 
 
291 aa  241  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
279 aa  235  7e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  48.86 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  47.04 
 
 
280 aa  219  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  48.85 
 
 
265 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
265 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
265 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
265 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 
265 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 
274 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  46.32 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  46.32 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 
262 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  40.93 
 
 
290 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3302  phosphomethylpyrimidine kinase  37.69 
 
 
276 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0829  putative phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 
283 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  42.16 
 
 
264 aa  166  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  38.19 
 
 
267 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  39.39 
 
 
253 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  38.96 
 
 
266 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  38.37 
 
 
266 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  36.72 
 
 
285 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3814  putative hydroxymethylpyrimidine kinase  35.29 
 
 
286 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00579021  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  34.94 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  37.85 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  35.43 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  36.4 
 
 
267 aa  146  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  35.18 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  35.79 
 
 
268 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  34 
 
 
269 aa  145  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  32.95 
 
 
270 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  34.66 
 
 
270 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3686  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.86 
 
 
294 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.532202  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  36.4 
 
 
252 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  35.83 
 
 
266 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  33.86 
 
 
260 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  39.08 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  31.5 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  37.22 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  36.6 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  35.69 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  34.13 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  34.13 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  34.13 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  32.17 
 
 
264 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  34.13 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  34.13 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  38.49 
 
 
267 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 
266 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0832  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.06 
 
 
288 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00416098  hitchhiker  0.0000421628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  34.5 
 
 
265 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0751  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.32 
 
 
288 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.490476  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  35.57 
 
 
266 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  34.51 
 
 
267 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
267 aa  137  2e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0379  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.06 
 
 
288 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0865  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  33.82 
 
 
286 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00118659  normal  0.187037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0861  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.06 
 
 
288 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  34.78 
 
 
266 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  34.9 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  32.58 
 
 
449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  36.05 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0734  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.32 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024549  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  37.66 
 
 
267 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  33.45 
 
 
266 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  35.18 
 
 
266 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  31.32 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  34.57 
 
 
281 aa  135  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  32.2 
 
 
269 aa  135  8e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
262 aa  135  8e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3959  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase-like  35.32 
 
 
288 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.112165 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  30.3 
 
 
432 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  37.16 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2527  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.4 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0489617 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0913  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  36.94 
 
 
282 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3174  hydroxymethylpyrimidine kinase  36.94 
 
 
282 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.262803  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  34.66 
 
 
260 aa  133  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1862  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  36.94 
 
 
282 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  34.44 
 
 
266 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  38.01 
 
 
269 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3152  putative phosphomethylpyrimidine kinase  36.94 
 
 
282 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2743  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  36.94 
 
 
282 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.531156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>