More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0542 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 432 aa  852    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 		 452 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  32.58 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  32.13 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  31.45 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  32.35 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  30.29 
 
 		 448 aa  219  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  29.31 
 
 		 456 aa  205  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  31.97 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  32.59 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  23.94 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  32.55 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  29.68 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  38.74 
 
 		 264 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  34.1 
 
 		 290 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  39.29 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  37.05 
 
 		 262 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  38.58 
 
 		 264 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  22.86 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  35.48 
 
 		 267 aa  167  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  38.25 
 
 		 267 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 		 269 aa  162  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  36.29 
 
 		 273 aa  159  7e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  37.55 
 
 		 265 aa  159  9e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  39.15 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  32.52 
 
 		 266 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  38.72 
 
 		 270 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  36.03 
 
 		 265 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03951  phosphomethylpyrimidine kinase  39.66 
 
 		 259 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.941064  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0362  phosphomethylpyrimidine kinase  40.09 
 
 		 259 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  40.89 
 
 		 269 aa  155  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0492  phosphomethylpyrimidine kinase  35.48 
 
 		 262 aa  155  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  30.68 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  31.9 
 
 		 269 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  37.85 
 
 		 262 aa  153  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 		 273 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 		 270 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  34.96 
 
 		 268 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  37.87 
 
 		 270 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  37.87 
 
 		 270 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  37.87 
 
 		 270 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  37.87 
 
 		 270 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  38.87 
 
 		 263 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  35.48 
 
 		 268 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  37.87 
 
 		 270 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03941  phosphomethylpyrimidine kinase  38.36 
 
 		 259 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  34.05 
 
 		 264 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  28.97 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  34.68 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  28.97 
 
 		 398 aa  151  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  32.16 
 
 		 285 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  37.02 
 
 		 270 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  36 
 
 		 267 aa  150  5e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  32.93 
 
 		 272 aa  149  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  34.58 
 
 		 270 aa  149  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  35.08 
 
 		 268 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1226  phosphomethylpyrimidine kinase  32 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  31.73 
 
 		 260 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  34.55 
 
 		 260 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  31.37 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 		 266 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04031  phosphomethylpyrimidine kinase  38.79 
 
 		 262 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.278475  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  31.37 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  23.67 
 
 		 461 aa  147  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  29.11 
 
 		 399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  37.71 
 
 		 260 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  33.86 
 
 		 270 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  26.24 
 
 		 436 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  32.27 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  36.6 
 
 		 270 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  31.9 
 
 		 263 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  30.89 
 
 		 269 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 		 270 aa  145  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 		 270 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 		 260 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  32.27 
 
 		 270 aa  144  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  32.9 
 
 		 479 aa  143  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 		 266 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  32.14 
 
 		 279 aa  143  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  31.35 
 
 		 268 aa  143  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  31.3 
 
 		 269 aa  143  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  31.87 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 		 266 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  33.61 
 
 		 286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  31.22 
 
 		 284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  31.65 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  31.23 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  35.06 
 
 		 257 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  31.47 
 
 		 270 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  32.43 
 
 		 277 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 		 264 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00132  phosphomethylpyrimidine kinase  31.47 
 
 		 269 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3672  phosphomethylpyrimidine kinase  32.94 
 
 		 284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.676544  normal  0.238942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  28.74 
 
 		 270 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1769  phosphomethylpyrimidine kinase  27.52 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0611594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  36 
 
 		 497 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  30.92 
 
 		 271 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  34.68 
 
 		 278 aa  139  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1501  phosphomethylpyrimidine kinase  35.9 
 
 		 271 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>