More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1769 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1769  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 396 aa  780    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0611594  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1032  phosphomethylpyrimidine kinase  83.21 
 
 		 394 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0912  phosphomethylpyrimidine kinase  79.59 
 
 		 394 aa  610  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  51.38 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  26.74 
 
 		 456 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  27.52 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  25.65 
 
 		 452 aa  138  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  26.08 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0381  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 		 259 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  33.61 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  36.48 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  28.52 
 
 		 285 aa  116  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  31.5 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  24.71 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  30.56 
 
 		 257 aa  114  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  36.36 
 
 		 264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  28.74 
 
 		 266 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  28.4 
 
 		 268 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  26.77 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  28.02 
 
 		 268 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  28.19 
 
 		 260 aa  110  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  28.79 
 
 		 288 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  30.04 
 
 		 262 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  27.56 
 
 		 272 aa  110  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 		 269 aa  109  7.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0184  phosphomethylpyrimidine kinase  27.66 
 
 		 403 aa  109  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000409945  normal  0.070974 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 		 270 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  33.87 
 
 		 264 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  27.73 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  28.74 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  26.15 
 
 		 518 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  28.74 
 
 		 269 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0845  hypothetical protein  27.95 
 
 		 266 aa  106  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.324232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  26.54 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  26.54 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  30.74 
 
 		 265 aa  106  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  29.13 
 
 		 270 aa  106  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  25.54 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  27.34 
 
 		 266 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  26.72 
 
 		 265 aa  105  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  27.34 
 
 		 266 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  27.34 
 
 		 266 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  27.34 
 
 		 266 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  27.34 
 
 		 266 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  30.47 
 
 		 266 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  27.34 
 
 		 266 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  27.34 
 
 		 266 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  27.34 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  27.34 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  25.42 
 
 		 283 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  25.2 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  24.76 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  27.45 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  24.34 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  28.02 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  30.47 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  24.67 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1453  phosphomethylpyrimidine kinase  24.35 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0659513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  24.34 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  25.42 
 
 		 308 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  28.93 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  25.2 
 
 		 254 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  24.32 
 
 		 449 aa  100  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  26.07 
 
 		 265 aa  100  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1662  Phosphomethylpyrimidine kinase  31.38 
 
 		 263 aa  99.8  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  27.64 
 
 		 276 aa  100  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  27.64 
 
 		 276 aa  100  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  29.83 
 
 		 270 aa  99.8  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  28.68 
 
 		 269 aa  99.4  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  30.8 
 
 		 273 aa  99  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  29.15 
 
 		 260 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  28.19 
 
 		 267 aa  98.6  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  26.59 
 
 		 270 aa  98.6  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 		 266 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  29.34 
 
 		 282 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  29.74 
 
 		 253 aa  98.2  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  28.99 
 
 		 497 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  26.67 
 
 		 264 aa  97.1  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0623  Phosphomethylpyrimidine kinase  26.84 
 
 		 255 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  24.43 
 
 		 267 aa  96.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  30.74 
 
 		 273 aa  96.3  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  27.69 
 
 		 323 aa  96.3  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  28.06 
 
 		 260 aa  96.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  23.77 
 
 		 453 aa  96.3  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0399  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 		 254 aa  96.3  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  26.56 
 
 		 266 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  26.75 
 
 		 264 aa  95.9  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  26.17 
 
 		 266 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  26.36 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  27.06 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  26.77 
 
 		 266 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1226  phosphomethylpyrimidine kinase  26.98 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  28.15 
 
 		 490 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  26.36 
 
 		 266 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  30.25 
 
 		 252 aa  94.4  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  26.72 
 
 		 303 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  28.52 
 
 		 266 aa  94.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  31.03 
 
 		 264 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  26.17 
 
 		 266 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>