More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0381 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0381  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  36.82 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  37.4 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  40.32 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  35.94 
 
 
268 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  37.25 
 
 
264 aa  171  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  35.38 
 
 
288 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  35.38 
 
 
288 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1662  Phosphomethylpyrimidine kinase  40.59 
 
 
263 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
270 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  35.27 
 
 
288 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  39.06 
 
 
263 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  38 
 
 
270 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  36.91 
 
 
273 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  38 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  35.77 
 
 
277 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  34.8 
 
 
271 aa  162  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  37.39 
 
 
281 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  38 
 
 
270 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  38.8 
 
 
270 aa  159  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  36 
 
 
265 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  34.77 
 
 
285 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  34.11 
 
 
266 aa  158  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  34.11 
 
 
266 aa  158  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  34.11 
 
 
266 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  34.11 
 
 
266 aa  158  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  34.11 
 
 
266 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  34.11 
 
 
266 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  34.11 
 
 
266 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  34.62 
 
 
436 aa  158  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  34.11 
 
 
266 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  34.11 
 
 
266 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  35.32 
 
 
284 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
266 aa  155  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  36.36 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  34.5 
 
 
265 aa  155  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  34.24 
 
 
266 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  34.13 
 
 
266 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  35.66 
 
 
265 aa  153  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  35.57 
 
 
262 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
266 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  34.63 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  32.58 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  37.21 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  35.16 
 
 
267 aa  152  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  35.97 
 
 
268 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  34.63 
 
 
268 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  35 
 
 
254 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  36.76 
 
 
264 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  38.17 
 
 
269 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  34.11 
 
 
269 aa  151  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  33.07 
 
 
267 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  37.71 
 
 
264 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  36.36 
 
 
479 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  32.55 
 
 
260 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  32.3 
 
 
271 aa  149  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
479 aa  148  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00801461  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 
269 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  32.95 
 
 
285 aa  148  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  32.82 
 
 
270 aa  148  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  37.94 
 
 
260 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  33.07 
 
 
267 aa  148  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  31.6 
 
 
267 aa  148  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  31.91 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  33.96 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  35.06 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  31.52 
 
 
267 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  35.27 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  31.49 
 
 
268 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  35.29 
 
 
497 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  34.89 
 
 
282 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  32.35 
 
 
484 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  30.33 
 
 
252 aa  143  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  32.17 
 
 
266 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
262 aa  143  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  32.92 
 
 
270 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  34.36 
 
 
266 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  34.58 
 
 
308 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  34.38 
 
 
277 aa  141  8e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  31.52 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  31.49 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  33.07 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  32.94 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  34.73 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  35.42 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  34.8 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  32.92 
 
 
285 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  33.19 
 
 
490 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  34.04 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  34.74 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  31.76 
 
 
268 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  34.8 
 
 
264 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  32.2 
 
 
531 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>