More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1662 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1662  Phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
263 aa  521  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0381  phosphomethylpyrimidine kinase  40.31 
 
 
259 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  37.2 
 
 
267 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  38 
 
 
264 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  36.08 
 
 
265 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  33.85 
 
 
272 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  37.6 
 
 
264 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  33.72 
 
 
436 aa  157  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  37.01 
 
 
260 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  34.53 
 
 
510 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  34.13 
 
 
270 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  38.04 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  32.17 
 
 
271 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
270 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
270 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  35.92 
 
 
270 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
270 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
270 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  35.51 
 
 
270 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  34.96 
 
 
270 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  36.58 
 
 
263 aa  151  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  36.08 
 
 
269 aa  150  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  33.88 
 
 
270 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  34.96 
 
 
273 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  32.93 
 
 
267 aa  149  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  32.27 
 
 
265 aa  149  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  35.1 
 
 
270 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
288 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
268 aa  148  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  35.02 
 
 
264 aa  148  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  34.55 
 
 
270 aa  148  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
260 aa  148  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  34.25 
 
 
449 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  32.3 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  32.3 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  32.23 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  32.3 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  32.3 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  35.36 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  33.71 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  32.3 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  32.3 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  32.3 
 
 
266 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  34.1 
 
 
269 aa  145  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  34.33 
 
 
260 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  31.91 
 
 
266 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  31.91 
 
 
266 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
257 aa  144  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  36.6 
 
 
281 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  33.88 
 
 
497 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  33.06 
 
 
484 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  34.4 
 
 
262 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  31.27 
 
 
288 aa  143  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  31.27 
 
 
288 aa  143  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  31.37 
 
 
266 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  31.37 
 
 
266 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  31.37 
 
 
266 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  35.43 
 
 
449 aa  141  9e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  34.98 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  31.37 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  31.37 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  35.36 
 
 
269 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  31.5 
 
 
266 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  31.76 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  33.06 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  32.55 
 
 
267 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  34.27 
 
 
286 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  32.05 
 
 
277 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1453  phosphomethylpyrimidine kinase  29.86 
 
 
289 aa  139  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0659513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  32.64 
 
 
266 aa  138  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  32.43 
 
 
265 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  32.17 
 
 
277 aa  138  8.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  31.92 
 
 
273 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  33.07 
 
 
444 aa  137  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  32.78 
 
 
266 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  31.37 
 
 
266 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  32.23 
 
 
484 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
450 aa  138  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 
490 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  32.81 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  31.91 
 
 
266 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  31.56 
 
 
276 aa  135  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  31.56 
 
 
276 aa  135  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  33.06 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  32.81 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  34.9 
 
 
269 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  35.42 
 
 
269 aa  135  8e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  29.71 
 
 
263 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  30.71 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  32.95 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  32.23 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  31.13 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  30.71 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  31.54 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  34.65 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  30.17 
 
 
497 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  31.4 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  31.95 
 
 
269 aa  133  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  31.28 
 
 
494 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>