More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0839 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  75.5 
 
 
449 aa  688    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
449 aa  907    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  75.4 
 
 
444 aa  692    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  74.94 
 
 
450 aa  696    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  47.72 
 
 
436 aa  332  7.000000000000001e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  43.37 
 
 
448 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 
445 aa  274  3e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 
452 aa  273  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  34.3 
 
 
444 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  40.36 
 
 
456 aa  265  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  39.33 
 
 
453 aa  246  6.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  32.35 
 
 
432 aa  243  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  38.58 
 
 
461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 
267 aa  223  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  44.14 
 
 
260 aa  216  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  51.59 
 
 
264 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  44.84 
 
 
272 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
270 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  47.64 
 
 
275 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  43.7 
 
 
264 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  51.55 
 
 
263 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 
265 aa  208  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 
273 aa  208  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  51.38 
 
 
266 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  46.89 
 
 
492 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 
497 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 
271 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
274 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 
267 aa  207  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
270 aa  206  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
264 aa  206  9e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 
266 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 
490 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  50.79 
 
 
271 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 
277 aa  204  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  48.43 
 
 
278 aa  203  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
285 aa  203  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 
268 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
273 aa  202  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  35.17 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 
266 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 
262 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
270 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  50.99 
 
 
283 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 
269 aa  201  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 
266 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
270 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
270 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
270 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
270 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 
264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
270 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  41.04 
 
 
279 aa  197  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1932  phosphomethylpyrimidine kinase  48.35 
 
 
297 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
276 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
276 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  45.88 
 
 
288 aa  196  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 
268 aa  196  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 
267 aa  196  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
265 aa  195  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
268 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  45.25 
 
 
264 aa  193  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 
266 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 
268 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 
264 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 
497 aa  192  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 
288 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 
288 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 
268 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 
271 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
267 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 
257 aa  190  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  48.8 
 
 
272 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2484  phosphomethylpyrimidine kinase  43.84 
 
 
275 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 
270 aa  189  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  44.84 
 
 
260 aa  189  9e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 
264 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  36.63 
 
 
461 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 
279 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 
266 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  40.48 
 
 
270 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  45.31 
 
 
260 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  47.7 
 
 
273 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  41.97 
 
 
274 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  43.08 
 
 
274 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  43.08 
 
 
274 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  43.08 
 
 
274 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  43.08 
 
 
274 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  43.08 
 
 
274 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  44.22 
 
 
264 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  43.08 
 
 
274 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  42.56 
 
 
275 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  42.06 
 
 
257 aa  184  3e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  43.08 
 
 
274 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  43.08 
 
 
274 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>