More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2592 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
254 aa  511  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  40.16 
 
 
257 aa  194  1e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 
260 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 
288 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  38.43 
 
 
270 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  40.7 
 
 
262 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  38.43 
 
 
270 aa  171  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  39.54 
 
 
264 aa  171  7.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  38.43 
 
 
270 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  37.89 
 
 
270 aa  169  5e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
277 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  39.27 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  43.46 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
270 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
270 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  39.22 
 
 
264 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
270 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
270 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 
270 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  35.27 
 
 
263 aa  163  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  36.43 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
273 aa  161  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  39.68 
 
 
270 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  39.68 
 
 
270 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  40.93 
 
 
265 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  40.77 
 
 
285 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  36.82 
 
 
270 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 
288 aa  158  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 
288 aa  158  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  40.77 
 
 
268 aa  158  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  36.22 
 
 
267 aa  158  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  38.85 
 
 
284 aa  158  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  40.7 
 
 
273 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  38.87 
 
 
270 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  38.61 
 
 
269 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  40.54 
 
 
271 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 
266 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  41.09 
 
 
280 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  38.87 
 
 
270 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  35.02 
 
 
265 aa  155  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0957  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
269 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.297451  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
266 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  38.87 
 
 
270 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  37.31 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  35.38 
 
 
295 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 
260 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  40.91 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0381  phosphomethylpyrimidine kinase  35 
 
 
259 aa  152  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  36.73 
 
 
510 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  33.85 
 
 
267 aa  151  1e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  35.66 
 
 
277 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1501  phosphomethylpyrimidine kinase  36.33 
 
 
271 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  40.53 
 
 
268 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  36.68 
 
 
262 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  35.88 
 
 
270 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  35 
 
 
286 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
268 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  36.43 
 
 
281 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  35.8 
 
 
269 aa  149  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  42.02 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  32.05 
 
 
273 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  36.68 
 
 
269 aa  146  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  42.02 
 
 
497 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  37.3 
 
 
268 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  37.98 
 
 
492 aa  144  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  36.29 
 
 
268 aa  145  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  37.4 
 
 
271 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  38.91 
 
 
484 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  37.86 
 
 
484 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  36.68 
 
 
267 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  40.98 
 
 
293 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 
308 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  38.17 
 
 
264 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  34.51 
 
 
264 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  39.51 
 
 
490 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  37.98 
 
 
267 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  38.85 
 
 
266 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  31.66 
 
 
276 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  31.66 
 
 
276 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  38.76 
 
 
271 aa  141  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70077  Phosphomethylpyrimidine kinase THI21 (HMP-phosphate kinase) (HMP-P kinase)  32.89 
 
 
583 aa  141  9e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.583202  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  38.37 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  31.65 
 
 
432 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  36.88 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  39.23 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  34.12 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  39.23 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  35.61 
 
 
275 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  36.15 
 
 
283 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  36.29 
 
 
266 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  35 
 
 
278 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  35.55 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  35.55 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  35.55 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  35.55 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  35.55 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>