More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0623 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0623  Phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
255 aa  520  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2468  Phosphomethylpyrimidine kinase  54.55 
 
 
268 aa  249  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1601  phosphomethylpyrimidine kinase  38.34 
 
 
251 aa  190  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0241  phosphomethylpyrimidine kinase  40.64 
 
 
249 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  37.89 
 
 
269 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.59 
 
 
647 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  38.25 
 
 
266 aa  119  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  36.73 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  36.58 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  34.78 
 
 
297 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 
266 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0845  hypothetical protein  34.96 
 
 
266 aa  113  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.324232  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  35.71 
 
 
270 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  35.34 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  38.43 
 
 
268 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  37.65 
 
 
270 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  35.8 
 
 
268 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  38.02 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  32.11 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  32.08 
 
 
257 aa  109  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  35.63 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  35.63 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  36.44 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  35.25 
 
 
264 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  33.87 
 
 
264 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 
270 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  33.87 
 
 
265 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1249  phosphomethylpyrimidine kinase  36.69 
 
 
280 aa  106  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal  0.283151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  36.4 
 
 
285 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  36.93 
 
 
264 aa  105  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1311  Phosphomethylpyrimidine kinase  29.92 
 
 
242 aa  105  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.275611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
264 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 
285 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  32.38 
 
 
290 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 
267 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  35.11 
 
 
518 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
264 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  32.61 
 
 
260 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
271 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  31.73 
 
 
265 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  35.43 
 
 
266 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  37.11 
 
 
267 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  36.99 
 
 
288 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  36.33 
 
 
269 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  35.92 
 
 
271 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
260 aa  102  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  35.1 
 
 
269 aa  102  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  32.93 
 
 
262 aa  101  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
271 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  36.89 
 
 
268 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  32.94 
 
 
267 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  35.8 
 
 
267 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
266 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  31.8 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  31.8 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  35.93 
 
 
268 aa  99.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  34.12 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  32.38 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2688  phosphomethylpyrimidine kinase  35.92 
 
 
275 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  33.89 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  33.86 
 
 
291 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  34.51 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0912  phosphomethylpyrimidine kinase  28.33 
 
 
394 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  32.92 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  34.94 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  31.38 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1769  phosphomethylpyrimidine kinase  26.84 
 
 
396 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0611594  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  30.96 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  30.96 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  33.19 
 
 
499 aa  96.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  35.38 
 
 
284 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  33.73 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  30.4 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  34.51 
 
 
265 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  36.36 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  34.01 
 
 
262 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  34.54 
 
 
265 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  30.96 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  33.63 
 
 
531 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  32.2 
 
 
436 aa  94.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0095  Phosphomethylpyrimidine kinase  35.08 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000458496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  32.78 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  34.4 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  34.78 
 
 
494 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  32.17 
 
 
290 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  34.51 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  37.13 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 
279 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1505  phosphomethylpyrimidine kinase  33.48 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0164576  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  30.42 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 
484 aa  93.2  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0300  Phosphomethylpyrimidine kinase  27.76 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000969067  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  35.94 
 
 
274 aa  92.4  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 
432 aa  92.8  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  28.4 
 
 
398 aa  92.4  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
281 aa  92  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  28.4 
 
 
398 aa  92  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>