More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2468 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2468  Phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 268 aa  554  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0623  Phosphomethylpyrimidine kinase  54.55 
 
 		 255 aa  249  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1601  phosphomethylpyrimidine kinase  40.16 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0241  phosphomethylpyrimidine kinase  37.1 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  34.15 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  34.15 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  34.15 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  34.66 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  34.75 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  35.04 
 
 		 267 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  33.6 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  36.03 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  33.6 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  34.44 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  34.26 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  34.44 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  33.6 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  35.44 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 647 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  35.86 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  33.88 
 
 		 276 aa  118  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  33.88 
 
 		 276 aa  118  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  34.63 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  33.89 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  31.71 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1311  Phosphomethylpyrimidine kinase  32.64 
 
 		 242 aa  117  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.275611  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  36.07 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  32.52 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  32.94 
 
 		 499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  36.07 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  34.26 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  32.27 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  34.68 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 		 262 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  32.81 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  34.19 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  31.3 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  32.37 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  36 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  33.05 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  31.17 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  34.75 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  32.94 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  29.63 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  32.67 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  34.16 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  32.27 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  34.45 
 
 		 277 aa  108  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  33.19 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  31.62 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0845  hypothetical protein  32.63 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.324232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  33.05 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  33.06 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  30.51 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  31.73 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  31.65 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  30.12 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  30.83 
 
 		 479 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  31.33 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.83 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00801461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  34.91 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  32.94 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  34.26 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  32.81 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  31.37 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  33.07 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  32.56 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  32.27 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  31.95 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  33.93 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1526  hypothetical protein  31.3 
 
 		 488 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  32.37 
 
 		 449 aa  101  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0915  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.315595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1453  phosphomethylpyrimidine kinase  29.63 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0659513  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  33.63 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  29.73 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  30.89 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  32.23 
 
 		 450 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  31.08 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  29.88 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  30.42 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2484  phosphomethylpyrimidine kinase  31.86 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  32.35 
 
 		 436 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  30.28 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  32.16 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  30.28 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  30.28 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  30.28 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  30.28 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  31.75 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  30.28 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  31.73 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  32.14 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  33.18 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>