More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1601 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1601  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2468  Phosphomethylpyrimidine kinase  40.16 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0623  Phosphomethylpyrimidine kinase  38.34 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0241  phosphomethylpyrimidine kinase  38.37 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.6 
 
 		 647 aa  131  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  29.73 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  29.73 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  37.97 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  29.18 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  32.55 
 
 		 285 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  35.27 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  30.86 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  37.55 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  31.69 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  31.92 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  31.15 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  30.08 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  29.72 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  28.63 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  29.08 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  33.76 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  29.08 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  29.18 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  36.1 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  23.9 
 
 		 499 aa  108  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  34.84 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  34.29 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  34.84 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  29.75 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  30.77 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  28.8 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  30.99 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  33.61 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1662  Phosphomethylpyrimidine kinase  32.26 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  30.58 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  28.52 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  29.76 
 
 		 285 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  31.58 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  32.3 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  31.43 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  32.77 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0381  phosphomethylpyrimidine kinase  30.8 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  27.56 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  30.89 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  27.27 
 
 		 531 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  28.15 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  30.74 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1453  phosphomethylpyrimidine kinase  25.75 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0659513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  27.53 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  28.46 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  28.29 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  26.98 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0095  Phosphomethylpyrimidine kinase  26.69 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000458496  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  28.24 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  26.56 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  32.49 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0083  phosphomethylpyrimidine kinase  26.32 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.165626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  29.17 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  26.67 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  32.35 
 
 		 270 aa  99  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  26.94 
 
 		 266 aa  98.6  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  29.92 
 
 		 276 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  29.92 
 
 		 276 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  32.24 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  26.72 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0254  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase  31.93 
 
 		 529 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  24.3 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  32.64 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  30.47 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  26.51 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  27.27 
 
 		 323 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  25.4 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  28.25 
 
 		 494 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  26.02 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  26.83 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  29.13 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  26.83 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  26.02 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  23.9 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  28.05 
 
 		 269 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  26.17 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  32.64 
 
 		 435 aa  95.9  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  26.32 
 
 		 267 aa  95.5  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  27.2 
 
 		 267 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13158 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  26.02 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  26.02 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  26.02 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  26.56 
 
 		 265 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  26.02 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  26.02 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  26.02 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  26.02 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  27.02 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  26.83 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  26.83 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  26.88 
 
 		 267 aa  95.1  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  28.29 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  25.3 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>