More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0095 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0095  Phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
253 aa  464  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000458496  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0083  phosphomethylpyrimidine kinase  93.68 
 
 
252 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.165626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0077  phosphomethylpyrimidine kinase  91.94 
 
 
247 aa  313  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.969606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0077  phosphomethylpyrimidine kinase  77.27 
 
 
263 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378315  normal  0.0460276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 
285 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  31.56 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  43.37 
 
 
266 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  43.67 
 
 
271 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 
297 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  32.56 
 
 
276 aa  141  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  32.56 
 
 
276 aa  141  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 
272 aa  141  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  37.96 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  35.8 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  45.12 
 
 
260 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  36.55 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  35.98 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 
262 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 
266 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  38.17 
 
 
265 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  44.73 
 
 
270 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 
268 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  46.34 
 
 
264 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  36.33 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 
265 aa  135  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  43.95 
 
 
266 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  39.59 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  35.91 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0954  putative phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  36.78 
 
 
267 aa  133  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  44.31 
 
 
267 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  37.04 
 
 
257 aa  133  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  45.85 
 
 
285 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 
268 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  35.56 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  35.66 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  40.78 
 
 
267 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  35.27 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  41.22 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  44.72 
 
 
490 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  41.31 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  37.74 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  45.37 
 
 
285 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  29.79 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 
518 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  40.09 
 
 
492 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  46.02 
 
 
499 aa  129  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  39.38 
 
 
266 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  39.61 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  41.13 
 
 
288 aa  126  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  39.61 
 
 
269 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  43.44 
 
 
283 aa  125  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  40.43 
 
 
497 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  42.98 
 
 
497 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  38.28 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  39.53 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  37.4 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  34.96 
 
 
270 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  34.55 
 
 
270 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  39.13 
 
 
288 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  39.13 
 
 
288 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  34.47 
 
 
269 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 
484 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  34.96 
 
 
270 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  39 
 
 
266 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  43.19 
 
 
269 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  43.09 
 
 
263 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
270 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
270 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
270 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
270 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 
484 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
270 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  42.98 
 
 
268 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  41.44 
 
 
267 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  38.19 
 
 
266 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  38.67 
 
 
267 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  38.61 
 
 
266 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  44.25 
 
 
267 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
270 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  33.74 
 
 
269 aa  122  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  43.09 
 
 
531 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  41.52 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  36.05 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  34.27 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  29.36 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  44.07 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  44.94 
 
 
267 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 
268 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  38.8 
 
 
269 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  43.52 
 
 
274 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  39.08 
 
 
266 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  38.66 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>