More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0241 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0241  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0623  Phosphomethylpyrimidine kinase  40.64 
 
 
255 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1601  phosphomethylpyrimidine kinase  38.37 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2468  Phosphomethylpyrimidine kinase  37.1 
 
 
268 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  34.98 
 
 
264 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1311  Phosphomethylpyrimidine kinase  34.76 
 
 
242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.275611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  30.92 
 
 
266 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  34.02 
 
 
260 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  30.45 
 
 
499 aa  121  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  36.65 
 
 
497 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1159  phosphomethylpyrimidine kinase  35.75 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  31.02 
 
 
268 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  30.61 
 
 
268 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  31.6 
 
 
518 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  32.81 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  31.3 
 
 
268 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  32.34 
 
 
257 aa  116  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  30.2 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  33.89 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  31.17 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  31.02 
 
 
276 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  31.02 
 
 
276 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  34.3 
 
 
494 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0095  Phosphomethylpyrimidine kinase  38.03 
 
 
253 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000458496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  30.4 
 
 
266 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  33.76 
 
 
266 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  30.4 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  30.4 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.63 
 
 
647 aa  112  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  30.4 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  31.54 
 
 
269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  36.18 
 
 
492 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  30.4 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  30.4 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  30.4 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1453  phosphomethylpyrimidine kinase  31.44 
 
 
289 aa  112  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0659513  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  30.49 
 
 
285 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  31.09 
 
 
266 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  31.23 
 
 
271 aa  111  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  32.37 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  31.95 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  30 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  31.98 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  31.84 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  32.69 
 
 
288 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  32.69 
 
 
288 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  32.92 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0083  phosphomethylpyrimidine kinase  38.03 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.165626  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  30.68 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  31.93 
 
 
277 aa  109  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  30.4 
 
 
266 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  32.34 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  31.12 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  34.71 
 
 
282 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 
266 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  31.09 
 
 
279 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  34.74 
 
 
484 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  31.45 
 
 
288 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 
266 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  31.76 
 
 
265 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  31.4 
 
 
267 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  31.87 
 
 
518 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  30.42 
 
 
271 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  33.04 
 
 
494 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  33.04 
 
 
531 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  33.05 
 
 
267 aa  105  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  29.92 
 
 
273 aa  105  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  32.49 
 
 
266 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  35.39 
 
 
490 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  32.34 
 
 
262 aa  105  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 
265 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  31.02 
 
 
267 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  31.51 
 
 
265 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  30.9 
 
 
265 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  31.84 
 
 
257 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  32.91 
 
 
446 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  29.88 
 
 
266 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  34.27 
 
 
484 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  32.94 
 
 
267 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
270 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  30.8 
 
 
269 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 
265 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  33.9 
 
 
264 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  33.74 
 
 
497 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  30.56 
 
 
269 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  30.99 
 
 
270 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  31.09 
 
 
267 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
265 aa  102  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  30.31 
 
 
266 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  31.12 
 
 
266 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  30.9 
 
 
265 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0364  phosphomethylpyrimidine kinase  32.03 
 
 
437 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.422328  normal  0.381325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  31.05 
 
 
266 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  31.56 
 
 
281 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>