More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0364 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0364  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
437 aa  843    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.422328  normal  0.381325 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  55.83 
 
 
446 aa  402  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  53.74 
 
 
453 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  55.71 
 
 
461 aa  381  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  59.94 
 
 
461 aa  350  3e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 
267 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  38.36 
 
 
449 aa  199  7e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
260 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 
288 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 
288 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
271 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  38.85 
 
 
269 aa  192  1e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  40.71 
 
 
264 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
285 aa  189  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
268 aa  189  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 
288 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  42.29 
 
 
270 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 
267 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  36.19 
 
 
452 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  35.35 
 
 
450 aa  186  7e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 
270 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  39.53 
 
 
264 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  38.55 
 
 
270 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
262 aa  183  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 
266 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  47.22 
 
 
264 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  37.37 
 
 
444 aa  181  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 
268 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  35.91 
 
 
273 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2484  phosphomethylpyrimidine kinase  39.71 
 
 
275 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  37.64 
 
 
290 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 
285 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 
285 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  47.3 
 
 
271 aa  178  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  35.16 
 
 
276 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  35.16 
 
 
276 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
260 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 
266 aa  177  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  41.47 
 
 
269 aa  176  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 
264 aa  176  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  45.86 
 
 
268 aa  176  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  40.39 
 
 
266 aa  176  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  43.53 
 
 
266 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0915  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.315595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  44.75 
 
 
267 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  43.14 
 
 
266 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 
266 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  44 
 
 
531 aa  173  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  38.58 
 
 
265 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  38.96 
 
 
270 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  40.93 
 
 
492 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  39.83 
 
 
267 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  35.81 
 
 
449 aa  172  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  40.39 
 
 
263 aa  172  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  38.96 
 
 
270 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  38.96 
 
 
270 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  38.96 
 
 
270 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 
266 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 
267 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 
269 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 
284 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  38.96 
 
 
270 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 
272 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  38.37 
 
 
269 aa  171  3e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  39.69 
 
 
266 aa  170  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  40.78 
 
 
266 aa  170  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  34.55 
 
 
436 aa  170  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  40.7 
 
 
267 aa  170  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  41.41 
 
 
267 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  50.98 
 
 
261 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
285 aa  169  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  42.45 
 
 
271 aa  169  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  47.81 
 
 
303 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  41.96 
 
 
497 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
263 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 
267 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 
282 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  38.71 
 
 
273 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  38.91 
 
 
260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  35.64 
 
 
270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
261 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 
275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
275 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 
261 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  35.64 
 
 
270 aa  167  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  38.55 
 
 
270 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  50.88 
 
 
299 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  41.64 
 
 
490 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  35.64 
 
 
270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  37.7 
 
 
257 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 
270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 
268 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 
280 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
268 aa  166  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  39.76 
 
 
265 aa  166  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 
283 aa  166  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>