More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3232 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  79.18 
 
 
461 aa  660    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
453 aa  893    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  66.59 
 
 
461 aa  530  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  57.81 
 
 
446 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0364  phosphomethylpyrimidine kinase  53.74 
 
 
437 aa  378  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.422328  normal  0.381325 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  40.4 
 
 
450 aa  276  5e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  39.73 
 
 
444 aa  269  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
449 aa  261  1e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  39.82 
 
 
456 aa  257  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  39.33 
 
 
449 aa  256  8e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  39.37 
 
 
448 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  39.11 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
271 aa  218  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.04 
 
 
266 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  48.69 
 
 
268 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  34 
 
 
445 aa  203  4e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
266 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 
270 aa  203  6e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  48.31 
 
 
268 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  25.06 
 
 
432 aa  202  9e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  48.62 
 
 
271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 
268 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  48.66 
 
 
269 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 
269 aa  195  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  39.54 
 
 
276 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
268 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  39.54 
 
 
276 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
277 aa  194  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  47.5 
 
 
269 aa  194  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  46.88 
 
 
269 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  39.25 
 
 
273 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  48.9 
 
 
285 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  28.25 
 
 
444 aa  190  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  47.43 
 
 
272 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  38.76 
 
 
269 aa  187  4e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 
270 aa  186  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  49.38 
 
 
271 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 
263 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  43.94 
 
 
266 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
265 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  47.04 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 
492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 
269 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  46.55 
 
 
304 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  50.93 
 
 
272 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  43.35 
 
 
269 aa  183  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 
261 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  43.36 
 
 
262 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
291 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
264 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
261 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1765  phosphomethylpyrimidine kinase  53.64 
 
 
260 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.962126  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  41.73 
 
 
270 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  46.03 
 
 
497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 
285 aa  180  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  47.58 
 
 
295 aa  180  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  45.91 
 
 
267 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  38.24 
 
 
270 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 
268 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 
268 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  44.63 
 
 
267 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0699  phosphomethylpyrimidine kinase  44.81 
 
 
269 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  40.87 
 
 
263 aa  178  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 
268 aa  177  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  38.24 
 
 
270 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 
288 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00132  phosphomethylpyrimidine kinase  50.79 
 
 
269 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  38.24 
 
 
270 aa  177  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  45.25 
 
 
497 aa  177  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  48.84 
 
 
267 aa  176  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 
265 aa  176  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 
308 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  44.13 
 
 
484 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  44.13 
 
 
484 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  43.66 
 
 
270 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  45.9 
 
 
282 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  41.13 
 
 
265 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 
266 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  43.36 
 
 
264 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  40.32 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
271 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  39.08 
 
 
279 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.75 
 
 
266 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 
264 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 
267 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  44.03 
 
 
297 aa  174  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  42.91 
 
 
518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  47.84 
 
 
283 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 
270 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 
270 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 
270 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 
295 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 
286 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 
267 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  42.86 
 
 
531 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  42.29 
 
 
282 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>