More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2988 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 461 aa  909    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  66.59 
 
 		 453 aa  553  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  62.56 
 
 		 461 aa  481  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  62.9 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0364  phosphomethylpyrimidine kinase  56.9 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.422328  normal  0.381325 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  38.53 
 
 		 450 aa  250  3e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  39.1 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  39.15 
 
 		 452 aa  249  6e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  39.49 
 
 		 456 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  37.61 
 
 		 449 aa  242  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  38.11 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  36.63 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  36.75 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  30.37 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  40.46 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  40.46 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0915  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 274 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.315595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 		 285 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  38.55 
 
 		 273 aa  192  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 266 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  43.73 
 
 		 269 aa  190  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  45.31 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 		 262 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  24.72 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  46.55 
 
 		 270 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  44.88 
 
 		 271 aa  187  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 		 268 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  44.69 
 
 		 492 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 		 270 aa  186  9e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 270 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  39.63 
 
 		 290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 		 268 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 		 267 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 285 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  45.26 
 
 		 497 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  47.86 
 
 		 260 aa  184  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  46.32 
 
 		 497 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  38.28 
 
 		 269 aa  183  6e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 		 269 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  38.13 
 
 		 270 aa  183  6e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  38.13 
 
 		 270 aa  183  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 		 268 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  42.15 
 
 		 267 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 		 275 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 271 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  44.78 
 
 		 288 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  44.78 
 
 		 288 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 		 266 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  37.3 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 		 268 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 268 aa  180  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 264 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 		 288 aa  180  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  41 
 
 		 267 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  43.84 
 
 		 282 aa  179  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 		 265 aa  179  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 		 271 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 		 263 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 304 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 		 266 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  45.62 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  39.3 
 
 		 264 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 		 279 aa  177  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 		 271 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  45.93 
 
 		 268 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  42.41 
 
 		 267 aa  176  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  37.74 
 
 		 267 aa  176  9e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  44.12 
 
 		 291 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  42.14 
 
 		 280 aa  176  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 		 267 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.7 
 
 		 270 aa  176  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 		 266 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  41.5 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  45.06 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  44.15 
 
 		 531 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 		 266 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 		 264 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 274 aa  173  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 259 aa  173  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 		 283 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  38.91 
 
 		 260 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  46.62 
 
 		 283 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  46.01 
 
 		 267 aa  172  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  39.38 
 
 		 263 aa  172  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  43.19 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.94 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  35.38 
 
 		 270 aa  171  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 		 266 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 270 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 270 aa  171  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  48.83 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  44.98 
 
 		 269 aa  171  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  42.58 
 
 		 268 aa  171  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 271 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 269 aa  170  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 266 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>