More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0828 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
452 aa  891    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  51.01 
 
 
448 aa  402  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  49.11 
 
 
456 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 
450 aa  299  7e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 
444 aa  298  2e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 
449 aa  286  7e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  34.02 
 
 
432 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 
449 aa  279  6e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  39.11 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  39.15 
 
 
461 aa  230  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  36.18 
 
 
461 aa  229  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  32.18 
 
 
429 aa  225  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  31.11 
 
 
444 aa  219  7e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  36.26 
 
 
436 aa  218  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  33.57 
 
 
445 aa  218  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
262 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 
270 aa  202  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 
270 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 
270 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
273 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
270 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  39.61 
 
 
270 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  45.9 
 
 
268 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  43.01 
 
 
264 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  37.7 
 
 
446 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  39.61 
 
 
270 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  39.61 
 
 
270 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  40.15 
 
 
270 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  39.61 
 
 
270 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  39.61 
 
 
270 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
270 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  39.78 
 
 
272 aa  189  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  38.34 
 
 
270 aa  189  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  39.52 
 
 
273 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  43.07 
 
 
267 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  30.07 
 
 
435 aa  188  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 
288 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 
288 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  43.53 
 
 
269 aa  186  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
267 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  44.65 
 
 
264 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0364  phosphomethylpyrimidine kinase  39.78 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.422328  normal  0.381325 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  41.44 
 
 
260 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 
490 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 
266 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  39.26 
 
 
267 aa  184  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
266 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  42.63 
 
 
269 aa  183  6e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 
288 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 
280 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
268 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  37.4 
 
 
264 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  43.7 
 
 
270 aa  177  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 
263 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 
268 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  37.02 
 
 
264 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  43.28 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 
497 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  41.48 
 
 
282 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  41.48 
 
 
282 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  36.33 
 
 
279 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  42 
 
 
283 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 
266 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  41.48 
 
 
282 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 
283 aa  173  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  44.2 
 
 
308 aa  173  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  40.15 
 
 
266 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1226  phosphomethylpyrimidine kinase  44.21 
 
 
261 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 
260 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 
268 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  35.82 
 
 
263 aa  172  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 
266 aa  172  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  40.15 
 
 
264 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  43.49 
 
 
264 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 
285 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  37.6 
 
 
269 aa  171  3e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  37.79 
 
 
269 aa  171  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  40.89 
 
 
267 aa  171  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  40.49 
 
 
269 aa  170  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  36.19 
 
 
276 aa  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  36.19 
 
 
276 aa  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
265 aa  170  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 
286 aa  170  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 
266 aa  170  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  39.45 
 
 
297 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 
266 aa  170  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 
266 aa  170  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 
266 aa  170  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 
266 aa  170  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 
266 aa  170  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  38.02 
 
 
274 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 
266 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  40.66 
 
 
266 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  35.77 
 
 
264 aa  169  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  38.02 
 
 
274 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 
266 aa  169  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  38.02 
 
 
274 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>