More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0646 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
445 aa  895    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  52.71 
 
 
444 aa  474  1e-132  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  40.13 
 
 
450 aa  319  6e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  39.55 
 
 
444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  38.57 
 
 
449 aa  293  4e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  38.34 
 
 
449 aa  281  2e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  34.11 
 
 
456 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  33.57 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  33.12 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  36.53 
 
 
461 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  32.96 
 
 
448 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  33.85 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  32.73 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  39.69 
 
 
267 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  32.53 
 
 
461 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  39.83 
 
 
270 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  39.83 
 
 
270 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  39.83 
 
 
270 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  39.83 
 
 
270 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  38.43 
 
 
266 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  39.33 
 
 
267 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  39.42 
 
 
270 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 
270 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  39.42 
 
 
273 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  39 
 
 
270 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  39.42 
 
 
270 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  38.59 
 
 
270 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  40.47 
 
 
264 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  41.77 
 
 
267 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  39 
 
 
270 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  36.16 
 
 
272 aa  170  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  36.64 
 
 
290 aa  169  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  42.58 
 
 
263 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
278 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 
266 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  42.13 
 
 
285 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  39.37 
 
 
275 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  34.21 
 
 
276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  34.21 
 
 
276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  31.33 
 
 
446 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 
279 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  39.08 
 
 
274 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  37.84 
 
 
268 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  38.67 
 
 
264 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 
262 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  38.28 
 
 
270 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  38.08 
 
 
266 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  38.08 
 
 
492 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  38.31 
 
 
270 aa  162  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  40.76 
 
 
260 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  37.21 
 
 
260 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  35.51 
 
 
264 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  42.92 
 
 
266 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  34.07 
 
 
273 aa  160  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0184  phosphomethylpyrimidine kinase  35.07 
 
 
403 aa  160  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000409945  normal  0.070974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  35.5 
 
 
266 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  37.05 
 
 
264 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34580  phosphomethylpyrimidine kinase  38.06 
 
 
279 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  37.05 
 
 
264 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  37.98 
 
 
277 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  39.16 
 
 
271 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 
270 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  37.21 
 
 
271 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0424  phosphomethylpyrimidine kinase  37.25 
 
 
276 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  37.21 
 
 
269 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  37.01 
 
 
265 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  35.5 
 
 
270 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  39.53 
 
 
260 aa  157  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  37.6 
 
 
266 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  37.13 
 
 
264 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 
272 aa  156  6e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  37.36 
 
 
288 aa  156  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  37.36 
 
 
288 aa  156  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  39.51 
 
 
264 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  39.23 
 
 
268 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  37.69 
 
 
268 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  37.65 
 
 
275 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  38.75 
 
 
269 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  39.36 
 
 
283 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  32.02 
 
 
267 aa  154  2.9999999999999998e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  35.36 
 
 
297 aa  154  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  37.55 
 
 
274 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  37.55 
 
 
274 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  38.14 
 
 
281 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  37.55 
 
 
274 aa  153  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  37.55 
 
 
274 aa  153  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  35.69 
 
 
270 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  35.69 
 
 
270 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  38.02 
 
 
267 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  38.91 
 
 
273 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  39.69 
 
 
271 aa  151  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  35.95 
 
 
497 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  37.21 
 
 
268 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  35.69 
 
 
270 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  35.63 
 
 
490 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  35.41 
 
 
271 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  37.15 
 
 
274 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  37.15 
 
 
274 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  37.15 
 
 
274 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  37.15 
 
 
274 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>