More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0424 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0424  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 276 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34580  phosphomethylpyrimidine kinase  65.54 
 
 		 279 aa  318  7.999999999999999e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  61.36 
 
 		 268 aa  316  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  57.56 
 
 		 280 aa  293  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  58.96 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  58.96 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  58.96 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  60.74 
 
 		 290 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.254816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0181  phosphomethylpyrimidine kinase  59.33 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0724  phosphomethylpyrimidine kinase  60.67 
 
 		 278 aa  261  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10427  phosphomethylpyrimidine kinase  58.05 
 
 		 265 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3738  phosphomethylpyrimidine kinase  60.15 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  57.59 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  52.81 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  51.32 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8032  phosphomethylpyrimidine kinase  55.93 
 
 		 290 aa  221  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  52.14 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  48.11 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3441  phosphomethylpyrimidine kinase  53.01 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.907993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3612  phosphomethylpyrimidine kinase  54.96 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  45.28 
 
 		 436 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 		 264 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  44.91 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  47.19 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 264 aa  204  9e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  43.94 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  47.11 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  40.53 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  50.98 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  41.73 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8003  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 272 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 		 270 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 		 450 aa  191  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 		 266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 		 444 aa  189  4e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 		 273 aa  188  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  48.86 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  48.12 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  48.11 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  42.32 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  45.15 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  38.55 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  41.73 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  41.73 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  38.31 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  38.31 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  38.31 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  38.31 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  38.31 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  43.17 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  38.31 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  38.31 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  38.31 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  38.31 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  38.31 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  38.55 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  42.15 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  42.28 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0143  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  40.07 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  46.13 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  45.79 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  40.87 
 
 		 449 aa  175  6e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1765  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.962126  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 266 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  33.95 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  45.76 
 
 		 303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  51.1 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  43.5 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  43.82 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3672  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.676544  normal  0.238942 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  38.24 
 
 		 277 aa  172  6.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  36.36 
 
 		 262 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  42.16 
 
 		 275 aa  171  9e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 		 490 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  40.22 
 
 		 510 aa  170  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  39.39 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>