More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1127 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 273 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3612  phosphomethylpyrimidine kinase  78.99 
 
 		 277 aa  347  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  70.88 
 
 		 268 aa  331  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3441  phosphomethylpyrimidine kinase  71.04 
 
 		 268 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.907993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8003  phosphomethylpyrimidine kinase  70.27 
 
 		 272 aa  298  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  63.18 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8032  phosphomethylpyrimidine kinase  70.37 
 
 		 290 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34580  phosphomethylpyrimidine kinase  57.69 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  54.9 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  57.87 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  55.89 
 
 		 282 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  55.89 
 
 		 282 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 		 264 aa  241  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  55.89 
 
 		 282 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0424  phosphomethylpyrimidine kinase  57.53 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  51.37 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  53.91 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  57.42 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  47.64 
 
 		 264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  52.94 
 
 		 288 aa  234  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  52.94 
 
 		 288 aa  234  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 436 aa  226  3e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  53.03 
 
 		 288 aa  222  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  55 
 
 		 285 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 		 271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 		 268 aa  222  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  49 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.31 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  47.01 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  51.57 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  54.76 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  51.76 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  54.98 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.254816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  52.96 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  57.65 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3738  phosphomethylpyrimidine kinase  56.78 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 		 270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 270 aa  215  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  48.41 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 		 273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  43.65 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  43.65 
 
 		 270 aa  211  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0181  phosphomethylpyrimidine kinase  52.61 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  43.25 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  56.76 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10427  phosphomethylpyrimidine kinase  57.59 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  54.15 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  56.37 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  51.66 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  52.85 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  43.77 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  54.41 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  47.43 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  53.75 
 
 		 497 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 		 280 aa  205  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  54.74 
 
 		 287 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  49 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.71 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  48.61 
 
 		 444 aa  201  9e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0724  phosphomethylpyrimidine kinase  52.99 
 
 		 278 aa  201  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974702 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  45.09 
 
 		 510 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  48.82 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  57.25 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 497 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  52.12 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  52.09 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 		 492 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  50.63 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  49.4 
 
 		 449 aa  199  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  51.89 
 
 		 268 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 		 271 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  42.47 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  41.86 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  41.86 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  41.86 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  41.86 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  41.86 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>