More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0649 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 290 aa  573  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.254816  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  68 
 
 		 280 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  70.21 
 
 		 282 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  70.21 
 
 		 282 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  70.21 
 
 		 282 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0181  phosphomethylpyrimidine kinase  68.23 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0724  phosphomethylpyrimidine kinase  70.92 
 
 		 278 aa  322  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3738  phosphomethylpyrimidine kinase  68.93 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10427  phosphomethylpyrimidine kinase  67.16 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0424  phosphomethylpyrimidine kinase  60.74 
 
 		 276 aa  292  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34580  phosphomethylpyrimidine kinase  58.39 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  53.41 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3441  phosphomethylpyrimidine kinase  52.96 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.907993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  45.32 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  56.37 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  49.09 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8032  phosphomethylpyrimidine kinase  53.5 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  45.83 
 
 		 264 aa  205  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 		 450 aa  204  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 		 444 aa  204  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  40.84 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 260 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  45.14 
 
 		 266 aa  195  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3612  phosphomethylpyrimidine kinase  52.85 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  44.72 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8003  phosphomethylpyrimidine kinase  50.55 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  41.11 
 
 		 270 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  41.11 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  39.47 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 		 267 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  40.37 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  47.19 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  40.51 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  46.86 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 		 490 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  37.83 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 268 aa  186  5e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  43.27 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  41 
 
 		 270 aa  185  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 		 270 aa  185  9e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 		 497 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 		 449 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  43.35 
 
 		 260 aa  181  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  43.48 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  36.26 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.6 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  44 
 
 		 484 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  40.61 
 
 		 260 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  35.61 
 
 		 273 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  42.16 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 		 484 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  38.02 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  38.4 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  41.85 
 
 		 494 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  41.48 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  41.48 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 		 497 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  36.73 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  40.52 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  42.55 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  37.87 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  41.2 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  41.2 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 261 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  41.51 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  40.37 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  37.5 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  37.5 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  37.5 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  37.5 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  38.43 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  40.67 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>