More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8003 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8003  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
272 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  84.33 
 
 
268 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3441  phosphomethylpyrimidine kinase  82.33 
 
 
268 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.907993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  70.04 
 
 
273 aa  305  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3612  phosphomethylpyrimidine kinase  68.6 
 
 
277 aa  288  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8032  phosphomethylpyrimidine kinase  67.29 
 
 
290 aa  278  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  60.08 
 
 
264 aa  276  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  52.92 
 
 
262 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34580  phosphomethylpyrimidine kinase  54.68 
 
 
279 aa  249  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
280 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  54.02 
 
 
263 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
267 aa  230  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 
283 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 
267 aa  228  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 
264 aa  228  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  44.14 
 
 
264 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
282 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
282 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
282 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 
290 aa  215  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  50.55 
 
 
285 aa  214  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 
270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
271 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  48.22 
 
 
260 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0424  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 
276 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0181  phosphomethylpyrimidine kinase  53.01 
 
 
287 aa  208  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
267 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  44.71 
 
 
260 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  48.66 
 
 
266 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  47.74 
 
 
288 aa  205  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  47.74 
 
 
288 aa  205  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
270 aa  205  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  40.67 
 
 
273 aa  205  7e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
270 aa  205  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 
270 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 
267 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  41.31 
 
 
270 aa  204  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 
268 aa  203  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 
270 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  45.31 
 
 
436 aa  203  3e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
267 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  48.22 
 
 
264 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  53.15 
 
 
264 aa  201  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  45.32 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
497 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  52.57 
 
 
497 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  46.1 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  49.37 
 
 
266 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  48.11 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  41.11 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  52.12 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  52.16 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  51.29 
 
 
290 aa  196  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.254816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  45.8 
 
 
270 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  49.45 
 
 
271 aa  194  9e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 
267 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  40.75 
 
 
274 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  40.75 
 
 
274 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  40.75 
 
 
274 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  40.75 
 
 
274 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  40.75 
 
 
274 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  47.19 
 
 
271 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 
269 aa  193  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  41.35 
 
 
273 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  52.55 
 
 
267 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  40.75 
 
 
274 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
308 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 
270 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  45.17 
 
 
267 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  40.75 
 
 
274 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  40.75 
 
 
274 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  40.75 
 
 
274 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 
260 aa  192  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  41.02 
 
 
257 aa  192  5e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  49.39 
 
 
259 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  46.1 
 
 
280 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 
268 aa  192  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3738  phosphomethylpyrimidine kinase  51.84 
 
 
295 aa  191  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 
270 aa  191  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 
270 aa  191  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 
270 aa  191  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 
267 aa  191  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 
270 aa  191  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 
490 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 
270 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 
264 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 
269 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 
494 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10427  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
265 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.206949  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 
279 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  45.32 
 
 
271 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>