More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3612 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3612  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 277 aa  537  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  78.99 
 
 		 273 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  68.82 
 
 		 268 aa  330  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3441  phosphomethylpyrimidine kinase  70.11 
 
 		 268 aa  308  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.907993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8003  phosphomethylpyrimidine kinase  68.85 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  60.16 
 
 		 264 aa  285  7e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8032  phosphomethylpyrimidine kinase  65.67 
 
 		 290 aa  278  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34580  phosphomethylpyrimidine kinase  57.84 
 
 		 279 aa  268  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  54.3 
 
 		 262 aa  258  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  52.01 
 
 		 280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  59.06 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 		 264 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 		 264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 		 268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0424  phosphomethylpyrimidine kinase  54.07 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  55 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  52.03 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  52.03 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  52.03 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  49.21 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  52.45 
 
 		 288 aa  232  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  52.45 
 
 		 288 aa  232  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  49.21 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  53.08 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  54.83 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  51.18 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  46.88 
 
 		 436 aa  214  9e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  52.67 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  48.61 
 
 		 450 aa  211  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  54.83 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  43.51 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  45.06 
 
 		 265 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  48.21 
 
 		 444 aa  209  5e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 		 270 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  45.25 
 
 		 270 aa  208  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  41.96 
 
 		 270 aa  208  8e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 		 270 aa  208  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  54.44 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  52.38 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.254816  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  55.21 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  43.92 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  38.28 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  41.38 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  41.38 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  41.38 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  41.38 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  41.38 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  41.38 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  41.38 
 
 		 274 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10427  phosphomethylpyrimidine kinase  53.64 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  41.38 
 
 		 274 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  54.12 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 270 aa  205  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3738  phosphomethylpyrimidine kinase  53.85 
 
 		 295 aa  205  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  41.38 
 
 		 274 aa  204  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  41.38 
 
 		 274 aa  204  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  52.29 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  50.4 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  48.78 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 		 275 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  48.55 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 		 497 aa  202  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  42.41 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  47.64 
 
 		 266 aa  201  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 		 268 aa  201  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  51.91 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0181  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 		 287 aa  201  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  44.87 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>