More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8032 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8032  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 290 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  66.91 
 
 		 268 aa  308  8e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3441  phosphomethylpyrimidine kinase  71.05 
 
 		 268 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.907993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  70.72 
 
 		 273 aa  295  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8003  phosphomethylpyrimidine kinase  67.29 
 
 		 272 aa  281  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3612  phosphomethylpyrimidine kinase  67.3 
 
 		 277 aa  269  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34580  phosphomethylpyrimidine kinase  56.83 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 		 268 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  56.11 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  53.85 
 
 		 280 aa  246  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 262 aa  242  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0424  phosphomethylpyrimidine kinase  55.93 
 
 		 276 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  56.34 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  56.34 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  56.34 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  56.3 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 288 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 288 aa  221  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 288 aa  221  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  43.46 
 
 		 264 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  51.5 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  43.35 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  54.26 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.254816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  45.9 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  50.75 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 279 aa  209  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0143  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  41.89 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0181  phosphomethylpyrimidine kinase  52.96 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10427  phosphomethylpyrimidine kinase  54.75 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3738  phosphomethylpyrimidine kinase  56.72 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773086  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  46.62 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 436 aa  202  4e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  48.3 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  41.42 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0724  phosphomethylpyrimidine kinase  54.44 
 
 		 278 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974702 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  48.13 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  45.32 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  52.29 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  47.78 
 
 		 270 aa  195  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  45.28 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  41.16 
 
 		 510 aa  193  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  46.27 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  48.52 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.28 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  51.91 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 		 264 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  47.96 
 
 		 285 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  47.96 
 
 		 268 aa  191  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  42.15 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  39.63 
 
 		 273 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 		 274 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 		 275 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  51.75 
 
 		 497 aa  188  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 270 aa  188  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  48.41 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  46.57 
 
 		 497 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 266 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  49.25 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  44.78 
 
 		 444 aa  186  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  45.79 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.12 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>