More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1782 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1271  phosphomethylpyrimidine kinase  62.22 
 
 		 271 aa  352  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000051939  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0143  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  57.35 
 
 		 275 aa  316  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1368  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  54.14 
 
 		 272 aa  283  3.0000000000000004e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  43.07 
 
 		 279 aa  235  6e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 277 aa  215  8e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  40.84 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  40.54 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  43.94 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  39.3 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  37.16 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  37.69 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  38.28 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  40.93 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 270 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  42.54 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  39 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  39 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  40.7 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  38.22 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  36.88 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  38.64 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  39.62 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  41.85 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  36.88 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  38.87 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  38.67 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  38.55 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  39.55 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  39.27 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  39.46 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  39.27 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  40.31 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  39.46 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  39.08 
 
 		 270 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  36.58 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  40.46 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 		 270 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  38.78 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  37.04 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  37.59 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  37.59 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  37.18 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  37.18 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  37.59 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  37.59 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  37.59 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  37.59 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  37.59 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  38.08 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  37.22 
 
 		 266 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  37.22 
 
 		 266 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  37.07 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  38.22 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  38.2 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  36.59 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  37.79 
 
 		 269 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  37.97 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0990  phosphomethylpyrimidine kinase  38.2 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  40.54 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  38.55 
 
 		 497 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  39.38 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  34.75 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  36.74 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  37.4 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  40.7 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8032  phosphomethylpyrimidine kinase  39 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  40.89 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1505  phosphomethylpyrimidine kinase  40.57 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0164576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  37.31 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  36.84 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  37.02 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  37.02 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  37.02 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  37.02 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  37.02 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  37.02 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  36.8 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>