More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0915 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0915  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 274 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.315595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  54.65 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  54.05 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  53.67 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  46.9 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  48.86 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 		 288 aa  205  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 		 288 aa  205  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 264 aa  204  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  51.31 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  41.25 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  45.31 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 		 271 aa  201  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  42.26 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  50.41 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 		 262 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  44.08 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 		 260 aa  198  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 274 aa  198  9e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  49.08 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  46.9 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  45.32 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1765  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 		 260 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.962126  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  43.19 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  43.19 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 263 aa  195  6e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3884  phosphomethylpyrimidine kinase  55.04 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  45 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  42.02 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4275  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.096784  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  45.15 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  42.25 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 497 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 		 280 aa  188  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  40 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 		 436 aa  188  9e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 		 271 aa  188  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 446 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  40.7 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  48.86 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  48.83 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 268 aa  185  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 		 266 aa  184  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 		 490 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  49.62 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  49.02 
 
 		 497 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>