More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1311 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1311  Phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
242 aa  485  1e-136  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.275611  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  35.46 
 
 
265 aa  151  8e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  35.08 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  32.11 
 
 
436 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  35 
 
 
276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  35 
 
 
276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  34.98 
 
 
266 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 
257 aa  142  7e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  36.69 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  34.73 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 
262 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  36.21 
 
 
270 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  36.21 
 
 
270 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  36.21 
 
 
270 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  36.21 
 
 
270 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  36.21 
 
 
270 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  37.19 
 
 
444 aa  136  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  35.65 
 
 
273 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  37.23 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  36.21 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  36.21 
 
 
270 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  36.1 
 
 
269 aa  135  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  34.68 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  35.34 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  32.68 
 
 
272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  33.06 
 
 
271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  35.78 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  35.08 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  33.04 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  34.84 
 
 
518 aa  129  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  35.62 
 
 
494 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  32.66 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0241  phosphomethylpyrimidine kinase  34.76 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  31.69 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  32.4 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  33.06 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
270 aa  126  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  33.76 
 
 
270 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  31.17 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  31.15 
 
 
450 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0381  phosphomethylpyrimidine kinase  34.48 
 
 
259 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  30.74 
 
 
444 aa  125  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  32.38 
 
 
449 aa  125  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  31.17 
 
 
264 aa  125  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  34.3 
 
 
266 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  31.45 
 
 
285 aa  125  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  33.19 
 
 
264 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1249  phosphomethylpyrimidine kinase  35.83 
 
 
280 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal  0.283151 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  32.11 
 
 
279 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  32.64 
 
 
267 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  30.87 
 
 
285 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
260 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  32.59 
 
 
490 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  33.91 
 
 
267 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  30.74 
 
 
449 aa  121  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  33.04 
 
 
497 aa  121  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1932  phosphomethylpyrimidine kinase  32.16 
 
 
297 aa  121  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  32.23 
 
 
267 aa  121  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  121  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  33.61 
 
 
264 aa  121  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  31.88 
 
 
492 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  32.44 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  30.89 
 
 
290 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  31.95 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  34.8 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  34.38 
 
 
497 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  31.7 
 
 
484 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  34.65 
 
 
268 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  30.53 
 
 
453 aa  119  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  31.17 
 
 
268 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  32.3 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  32 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  31.17 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  32.46 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1662  Phosphomethylpyrimidine kinase  32.92 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  35.27 
 
 
269 aa  119  6e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  31.51 
 
 
271 aa  118  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  34.07 
 
 
494 aa  118  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1226  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
261 aa  118  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  32.75 
 
 
266 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  33.79 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  32.78 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  30.16 
 
 
291 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  32.37 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2468  Phosphomethylpyrimidine kinase  32.64 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  32.37 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  31.14 
 
 
484 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  32.77 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0184  phosphomethylpyrimidine kinase  33.93 
 
 
403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000409945  normal  0.070974 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2484  phosphomethylpyrimidine kinase  32.61 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2054  phosphomethylpyrimidine kinase  31 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>