More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1249 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1249  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal  0.283151 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  46.27 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1226  phosphomethylpyrimidine kinase  49.01 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0845  hypothetical protein  42.46 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.324232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 		 268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  46.5 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  45.31 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  45.83 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  47.16 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  45.83 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  42.74 
 
 		 271 aa  175  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  43.93 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  43.33 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  38.49 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  39.36 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  39.36 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  40.87 
 
 		 288 aa  168  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  40.87 
 
 		 288 aa  168  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  38.8 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  40.89 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  40.89 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  38.49 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  41.85 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  41.49 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1271  phosphomethylpyrimidine kinase  39.68 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000051939  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  40.24 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  41.85 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  42.13 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  43.78 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  40.74 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  41.41 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  41.41 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00132  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  41.41 
 
 		 269 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  42.13 
 
 		 518 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  40.89 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  41.08 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  41.25 
 
 		 450 aa  162  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  40.94 
 
 		 266 aa  161  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  40.49 
 
 		 269 aa  161  9e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  43.93 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  40.94 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  41.52 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  41 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  40.97 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2688  phosphomethylpyrimidine kinase  45.93 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  41.42 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  41.52 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  41.52 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  41.52 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  41.52 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  41.34 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  40.82 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  41.41 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  43.9 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  36.07 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  45.5 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  44.54 
 
 		 452 aa  159  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  40.57 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  44.16 
 
 		 264 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  42.92 
 
 		 272 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.16 
 
 		 270 aa  159  7e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  40.57 
 
 		 266 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  41.39 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  43.32 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  40.57 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  37.97 
 
 		 267 aa  158  1e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  40.57 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  40.79 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  42.98 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  40.57 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  39.3 
 
 		 436 aa  156  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  40.49 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  44.3 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  41.25 
 
 		 449 aa  156  4e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  42.06 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  37.13 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  38.93 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  37.13 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  40.09 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  37.13 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  40.95 
 
 		 273 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>