More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3900 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 291 aa  589  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  63.97 
 
 		 279 aa  368  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  61.09 
 
 		 281 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  60.81 
 
 		 280 aa  335  5e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  55.09 
 
 		 269 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3814  putative hydroxymethylpyrimidine kinase  45.55 
 
 		 286 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00579021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0751  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  44.13 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.490476  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0865  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  44.84 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00118659  normal  0.187037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0734  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  44.13 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3959  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase-like  44.13 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.112165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  48.18 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0379  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  43.42 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0861  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  43.42 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0832  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  43.42 
 
 		 288 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00416098  hitchhiker  0.0000421628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3686  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  43.25 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.532202  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1862  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  43.82 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2000  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  43.82 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3174  hydroxymethylpyrimidine kinase  43.82 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.262803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3116  putative phosphomethylpyrimidine kinase  43.82 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1459  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  43.82 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0913  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  43.82 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2743  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  43.82 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.531156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3152  putative phosphomethylpyrimidine kinase  43.82 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  45.66 
 
 		 290 aa  215  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 		 274 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 		 265 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2527  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  43.28 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0489617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2331  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  45.32 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940899  normal  0.0456553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  47.67 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  46.56 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0829  putative phosphomethylpyrimidine kinase  37.72 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  38.17 
 
 		 260 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3023  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.77 
 
 		 320 aa  168  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3192  hydroxymethylpyrimidine kinase  39.42 
 
 		 319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394999  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3302  phosphomethylpyrimidine kinase  37.17 
 
 		 276 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.69 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348209  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  39.09 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  38.68 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  38.25 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3580  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.13 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0582883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  38.61 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  38.27 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3356  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.13 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.417961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1570  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.97 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1134  putative phosphomethylpyrimidine kinase  36.6 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3973  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.5 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00627703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  39.54 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  39.54 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  37.7 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  36.98 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  34.59 
 
 		 264 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  38.65 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  37.94 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  35.34 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  35.5 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  37.75 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  36.36 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0899  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.5 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  35.57 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  36.95 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4628  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.79 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  40.83 
 
 		 270 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  33.33 
 
 		 510 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  39.68 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  39.44 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  41.43 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  36.15 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  36.55 
 
 		 273 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  36.14 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  34.21 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  38.65 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  34.14 
 
 		 492 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  39.3 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  35.57 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  37.89 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  32.83 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  33.61 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  34.82 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  39.33 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  40.56 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>