More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3302 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3302  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
276 aa  545  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  37.12 
 
 
291 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
265 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  41.7 
 
 
290 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  38.95 
 
 
279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  40.37 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  36.67 
 
 
281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 
271 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  37.69 
 
 
285 aa  160  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 
271 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  41.2 
 
 
265 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 
265 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 
265 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 
274 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 
265 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 
265 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  37.17 
 
 
280 aa  153  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  39.08 
 
 
265 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  39.08 
 
 
265 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  38.31 
 
 
262 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  37.79 
 
 
253 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  34.1 
 
 
260 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  32.59 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  27.38 
 
 
432 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  33.45 
 
 
264 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  28.4 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  28.4 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  33.09 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  29 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  37.6 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  37.18 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  26.85 
 
 
273 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  28.25 
 
 
264 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  33.72 
 
 
285 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  31.99 
 
 
286 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  32.01 
 
 
269 aa  123  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  32.1 
 
 
281 aa  123  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  33.72 
 
 
284 aa  122  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  31.88 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  34.57 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
268 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
268 aa  118  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  29.57 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  29.96 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  30.71 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  31.43 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  29.46 
 
 
269 aa  116  3e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  31.39 
 
 
264 aa  115  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  32.5 
 
 
268 aa  116  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  32.25 
 
 
282 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  36.59 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  32.59 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  35.77 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
277 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  40.23 
 
 
277 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
283 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  31.16 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  31.73 
 
 
266 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  36.04 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  34.23 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  34.23 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  33.21 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  33.74 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  27.51 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  27.99 
 
 
262 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
270 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  34.18 
 
 
269 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  28.52 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  32.94 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  30.71 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  25.75 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  24.15 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  31.3 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  30.9 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  33.48 
 
 
266 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  31.73 
 
 
266 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  27.07 
 
 
269 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  27.8 
 
 
265 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  29.74 
 
 
510 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  29.39 
 
 
270 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
259 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  26.12 
 
 
270 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  37.6 
 
 
269 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  32.2 
 
 
268 aa  105  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  31.06 
 
 
264 aa  105  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  26.12 
 
 
270 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1501  phosphomethylpyrimidine kinase  30.38 
 
 
271 aa  105  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  29.15 
 
 
265 aa  105  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  24.51 
 
 
429 aa  104  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  30.48 
 
 
436 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  25.75 
 
 
272 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  33.21 
 
 
267 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  31.85 
 
 
449 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  33.07 
 
 
267 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  32.3 
 
 
267 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  25.37 
 
 
270 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  32.82 
 
 
264 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2566  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 
256 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  30.86 
 
 
444 aa  103  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  34.65 
 
 
284 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>