More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2566 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2566  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 256 aa  501  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  43.67 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  43.67 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  41.87 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  40.16 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  40.74 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  43.95 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  38.71 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  38.71 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  38.71 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  38.71 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  38.71 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  40.4 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  38.71 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  38.71 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  43.95 
 
 		 291 aa  158  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  38.31 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  38.31 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  39.52 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  39.52 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  39.68 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  43.19 
 
 		 267 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  39.11 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  39.45 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  38.15 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 		 270 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  41.56 
 
 		 269 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  37.08 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  40.95 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  41.32 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  44.71 
 
 		 531 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  36.14 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  42.15 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  37.75 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  39.27 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  36.84 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  38.15 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  40.24 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  37.05 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  37.66 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  39.74 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  38.15 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  39.3 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  38.15 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  33.07 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  38.8 
 
 		 284 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  36.44 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  36.07 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  38.59 
 
 		 444 aa  142  4e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  38.1 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  39.68 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  37.7 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  37.28 
 
 		 282 aa  141  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  38.59 
 
 		 450 aa  142  8e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  40.59 
 
 		 288 aa  141  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  40.82 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  42.06 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  35.53 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0368  phosphomethylpyrimidine kinase  39.11 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  37.6 
 
 		 436 aa  138  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  38.17 
 
 		 449 aa  138  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  43.1 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  36.44 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  42.5 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  40.53 
 
 		 285 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  34.15 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  42.5 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  37.65 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  32.23 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  40.64 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  36.1 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  38.63 
 
 		 449 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  40.74 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  39.91 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  35.63 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  34.47 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  39.91 
 
 		 269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  39.91 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  36.68 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  40.65 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  36.07 
 
 		 290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  35.63 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  35.77 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  38.06 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  38.91 
 
 		 308 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  34.68 
 
 		 268 aa  131  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1352  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 		 269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00443333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>