More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0393 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 262 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 		 279 aa  208  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  44.92 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 265 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  47.64 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  47.64 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  47.84 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  47.64 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  46.85 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  47.24 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 		 265 aa  181  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  45.28 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  45.67 
 
 		 265 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  49.8 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  41.43 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  40.64 
 
 		 264 aa  175  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  45.71 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  46.94 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  45.31 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 		 267 aa  168  9e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  47.86 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  40.98 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  41.35 
 
 		 269 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  37.05 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  43.48 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  38.76 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  47.23 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  38.4 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  39.22 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  44.31 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  41.43 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  43.5 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  45.67 
 
 		 295 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  44.08 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  41.13 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  43.15 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  44.67 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  41.41 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  38.98 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  42.4 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  39.22 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  38.98 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  38.98 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  42.4 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  34.88 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  36.18 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  38.7 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  38.15 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  38.93 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  40.41 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  46.06 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 		 297 aa  148  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1505  phosphomethylpyrimidine kinase  43.92 
 
 		 269 aa  148  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0164576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  42 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  38.65 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  38.65 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  38.65 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  38.65 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  38.65 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  40.16 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  41.32 
 
 		 323 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>