More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2419 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
269 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  57.84 
 
 
279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  55.38 
 
 
291 aa  295  6e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  52.59 
 
 
281 aa  288  7e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  58.21 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  54.62 
 
 
280 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
265 aa  248  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  52.87 
 
 
271 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 
265 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  52.11 
 
 
265 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 
271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  50.57 
 
 
265 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  52.11 
 
 
265 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 
274 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  52.11 
 
 
265 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 
265 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 
265 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  47.53 
 
 
290 aa  219  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 
262 aa  194  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  47.96 
 
 
277 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  47.96 
 
 
277 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0829  putative phosphomethylpyrimidine kinase  39.38 
 
 
283 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3814  putative hydroxymethylpyrimidine kinase  41.04 
 
 
286 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00579021  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3686  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  42.01 
 
 
294 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.532202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3959  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase-like  41.91 
 
 
288 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.112165 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0832  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  41.54 
 
 
288 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00416098  hitchhiker  0.0000421628 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0379  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  41.54 
 
 
288 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0861  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  41.54 
 
 
288 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0751  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  41.18 
 
 
288 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.490476  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0734  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  41.18 
 
 
288 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2527  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  41.64 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0489617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0865  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  40.67 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00118659  normal  0.187037 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2000  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  41.04 
 
 
282 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3174  hydroxymethylpyrimidine kinase  41.04 
 
 
282 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.262803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3116  putative phosphomethylpyrimidine kinase  41.04 
 
 
282 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3152  putative phosphomethylpyrimidine kinase  41.04 
 
 
282 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0913  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  41.04 
 
 
282 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1459  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  41.04 
 
 
282 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1862  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  41.04 
 
 
282 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2743  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  41.04 
 
 
282 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.531156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  41.04 
 
 
253 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3302  phosphomethylpyrimidine kinase  40.37 
 
 
276 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  39.62 
 
 
264 aa  168  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2331  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  41.73 
 
 
286 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940899  normal  0.0456553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
264 aa  161  9e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  37.89 
 
 
260 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3580  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.55 
 
 
314 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0582883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.55 
 
 
314 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3973  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.45 
 
 
310 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00627703 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  40.5 
 
 
266 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  40.48 
 
 
284 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  37.94 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  35.46 
 
 
269 aa  146  3e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  38.06 
 
 
268 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
290 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
268 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  38.27 
 
 
268 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  38.1 
 
 
269 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  35.97 
 
 
285 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  33.83 
 
 
269 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  36.22 
 
 
266 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  35.54 
 
 
252 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1570  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.83 
 
 
318 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  38.68 
 
 
268 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  35.25 
 
 
450 aa  143  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3192  hydroxymethylpyrimidine kinase  38.06 
 
 
319 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394999  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  34.55 
 
 
257 aa  142  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  35.57 
 
 
268 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  34.75 
 
 
444 aa  141  9e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  35.34 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  34.24 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  35.91 
 
 
449 aa  140  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1134  putative phosphomethylpyrimidine kinase  38.08 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  36.29 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0899  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.92 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  38.1 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  35.61 
 
 
449 aa  137  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  34.27 
 
 
264 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
262 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  30.34 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  30.34 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  37.97 
 
 
270 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3023  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.88 
 
 
320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  33.84 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  32.95 
 
 
270 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  34.14 
 
 
267 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  36.76 
 
 
268 aa  135  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 
270 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  35.34 
 
 
260 aa  135  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  30.34 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  36.18 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  35.02 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  38.8 
 
 
484 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  29.55 
 
 
432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  34.54 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  37.6 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3672  phosphomethylpyrimidine kinase  39.11 
 
 
284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.676544  normal  0.238942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  36.52 
 
 
285 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>