More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0899 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0899  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  100 
 
 
318 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3023  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  71.38 
 
 
320 aa  455  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3580  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  68.75 
 
 
314 aa  434  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0582883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  69.06 
 
 
314 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1570  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  68.54 
 
 
318 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1134  putative phosphomethylpyrimidine kinase  68.4 
 
 
335 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3356  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  62.95 
 
 
324 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.417961  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4628  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  65.08 
 
 
321 aa  360  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3973  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  54.33 
 
 
310 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00627703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3192  hydroxymethylpyrimidine kinase  55.02 
 
 
319 aa  299  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394999  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  39.05 
 
 
279 aa  176  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  39.05 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  37.27 
 
 
291 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3814  putative hydroxymethylpyrimidine kinase  40.07 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00579021  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  41.95 
 
 
280 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0865  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  40.81 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00118659  normal  0.187037 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  38.75 
 
 
269 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2331  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  40 
 
 
286 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940899  normal  0.0456553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3959  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase-like  37.68 
 
 
288 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.112165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0379  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.68 
 
 
288 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0861  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.68 
 
 
288 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3152  putative phosphomethylpyrimidine kinase  38.18 
 
 
282 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2000  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  38.18 
 
 
282 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3174  hydroxymethylpyrimidine kinase  38.18 
 
 
282 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.262803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1459  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  38.18 
 
 
282 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1862  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  38.18 
 
 
282 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0913  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  38.18 
 
 
282 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3116  putative phosphomethylpyrimidine kinase  38.18 
 
 
282 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2743  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  38.18 
 
 
282 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.531156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0832  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.68 
 
 
288 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00416098  hitchhiker  0.0000421628 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0734  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.32 
 
 
288 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0751  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.32 
 
 
288 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.490476  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2527  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.36 
 
 
323 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0489617 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0829  putative phosphomethylpyrimidine kinase  32.13 
 
 
283 aa  125  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3686  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.54 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.532202  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  30.42 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
265 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  31.01 
 
 
265 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  31.42 
 
 
274 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  32.56 
 
 
271 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  32.05 
 
 
271 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  30.77 
 
 
277 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  30.77 
 
 
277 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  30.65 
 
 
265 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  30.23 
 
 
265 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  31.03 
 
 
265 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  31.7 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  30.65 
 
 
265 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  30.27 
 
 
265 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  28.57 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  24.9 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  29.74 
 
 
262 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  29.27 
 
 
280 aa  85.9  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  29.02 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  24.38 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  28.19 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  28.24 
 
 
518 aa  79.7  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  30.25 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  24.74 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  26.16 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1501  phosphomethylpyrimidine kinase  26.18 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  25.81 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  24.31 
 
 
269 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  25 
 
 
267 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  30.29 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  25.81 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  26.74 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  25.74 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3302  phosphomethylpyrimidine kinase  26.95 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8032  phosphomethylpyrimidine kinase  29.22 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  27.14 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  23.62 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  25.21 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  27.31 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  27.1 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  24.81 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  27.1 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  28.46 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  27.1 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  28.85 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  25.95 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  25.9 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  28.46 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  24.43 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  25.68 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  26.72 
 
 
285 aa  67  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  28.74 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  26.03 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  27.2 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  26.34 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  27.84 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  23.83 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  30.62 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1249  phosphomethylpyrimidine kinase  25.73 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal  0.283151 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  27.87 
 
 
257 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  22.43 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  25 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  27.62 
 
 
268 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  26.67 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  26.32 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>