More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3023 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3023  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  100 
 
 
320 aa  647    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0899  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  71.38 
 
 
318 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3580  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  64.44 
 
 
314 aa  418  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0582883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1570  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  66.36 
 
 
318 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  64.44 
 
 
314 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1134  putative phosphomethylpyrimidine kinase  67.21 
 
 
335 aa  391  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4628  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  65.7 
 
 
321 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3356  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  65.26 
 
 
324 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.417961  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3973  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  53.21 
 
 
310 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00627703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3192  hydroxymethylpyrimidine kinase  51.77 
 
 
319 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394999  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 
281 aa  169  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  37.82 
 
 
291 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  39.93 
 
 
279 aa  165  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
280 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3814  putative hydroxymethylpyrimidine kinase  36.43 
 
 
286 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00579021  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0865  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.69 
 
 
286 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00118659  normal  0.187037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0832  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.98 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00416098  hitchhiker  0.0000421628 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0379  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.98 
 
 
288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0861  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.98 
 
 
288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0734  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  34.94 
 
 
288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0751  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  34.94 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.490476  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2000  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  35.56 
 
 
282 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3174  hydroxymethylpyrimidine kinase  35.56 
 
 
282 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.262803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2743  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  35.56 
 
 
282 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.531156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1459  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  35.56 
 
 
282 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2527  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.74 
 
 
323 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0489617 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3116  putative phosphomethylpyrimidine kinase  35.56 
 
 
282 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0913  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  35.56 
 
 
282 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3152  putative phosphomethylpyrimidine kinase  35.56 
 
 
282 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1862  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  35.56 
 
 
282 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2331  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.17 
 
 
286 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940899  normal  0.0456553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3959  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase-like  34.94 
 
 
288 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.112165 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  36.02 
 
 
269 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3686  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  34.86 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.532202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0829  putative phosphomethylpyrimidine kinase  29.93 
 
 
283 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  30.85 
 
 
285 aa  106  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  32.56 
 
 
265 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  30.5 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  30.3 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  31.27 
 
 
277 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  30.5 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  31.27 
 
 
277 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  29.7 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  30.12 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  31.4 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  32.33 
 
 
271 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  29.73 
 
 
265 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  29.52 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  29.04 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  28.95 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  27.21 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  27.31 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  28.52 
 
 
260 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  29.63 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  28.46 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  29.32 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  23.05 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  26.47 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  27.66 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  29.02 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3302  phosphomethylpyrimidine kinase  28.52 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  23.26 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  27.48 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  27.48 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  27.48 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  27.92 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  24.44 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  28.69 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  29.07 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  30.56 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  28.28 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  21.74 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  28.4 
 
 
271 aa  68.9  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  28.74 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  25.27 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  25.74 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  32.37 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8032  phosphomethylpyrimidine kinase  29.28 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  27.53 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  23.99 
 
 
272 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  26.39 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  26.82 
 
 
269 aa  67  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  26.64 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  25.66 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  32.12 
 
 
494 aa  66.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  28.72 
 
 
518 aa  65.9  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  27.48 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  27 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3441  phosphomethylpyrimidine kinase  28.21 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.907993  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  26.47 
 
 
510 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  26.89 
 
 
269 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  26.48 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  27.8 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  26.82 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  22.88 
 
 
281 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  28.24 
 
 
497 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0181  phosphomethylpyrimidine kinase  28.99 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0364  phosphomethylpyrimidine kinase  28.06 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.422328  normal  0.381325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  26.74 
 
 
253 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>