More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3686 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3686  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  100 
 
 
294 aa  570  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.532202  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 
281 aa  248  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 
279 aa  239  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  44.13 
 
 
291 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  45.99 
 
 
280 aa  227  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3814  putative hydroxymethylpyrimidine kinase  45.14 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00579021  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3116  putative phosphomethylpyrimidine kinase  46.29 
 
 
282 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2000  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  46.29 
 
 
282 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3174  hydroxymethylpyrimidine kinase  46.29 
 
 
282 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.262803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0865  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  45.39 
 
 
286 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00118659  normal  0.187037 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0913  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  46.29 
 
 
282 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1459  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  46.29 
 
 
282 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0832  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  45.61 
 
 
288 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00416098  hitchhiker  0.0000421628 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2743  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  46.29 
 
 
282 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.531156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3152  putative phosphomethylpyrimidine kinase  46.29 
 
 
282 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0379  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  45.61 
 
 
288 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1862  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  46.29 
 
 
282 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0861  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  45.61 
 
 
288 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3959  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase-like  45.26 
 
 
288 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.112165 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0751  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  44.56 
 
 
288 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.490476  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0734  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  44.56 
 
 
288 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2527  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  45.2 
 
 
323 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0489617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2331  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  45.83 
 
 
286 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940899  normal  0.0456553 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  42.01 
 
 
269 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3973  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.71 
 
 
310 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00627703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1570  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.89 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3192  hydroxymethylpyrimidine kinase  39.18 
 
 
319 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394999  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  36.93 
 
 
285 aa  146  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3580  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.97 
 
 
314 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0582883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.97 
 
 
314 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348209  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0829  putative phosphomethylpyrimidine kinase  31.6 
 
 
283 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1134  putative phosphomethylpyrimidine kinase  36.4 
 
 
335 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3023  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.36 
 
 
320 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3356  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.49 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.417961  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  38.25 
 
 
277 aa  132  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  38.25 
 
 
277 aa  132  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4628  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.5 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0899  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.71 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  32.74 
 
 
271 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  33.94 
 
 
260 aa  126  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  34.16 
 
 
271 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  32.74 
 
 
265 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  31.67 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  34.67 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  34.67 
 
 
265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  34.31 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  33.21 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  32.03 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  31.79 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  33.22 
 
 
253 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  34.3 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  32.85 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3302  phosphomethylpyrimidine kinase  31.72 
 
 
276 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  27.74 
 
 
267 aa  99.4  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
264 aa  99  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  28.72 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  31.67 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  28.83 
 
 
268 aa  96.3  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  27.72 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  24.37 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  28.62 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  31.52 
 
 
270 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  33.21 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  33.08 
 
 
497 aa  92.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  28.98 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  28.74 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  26.39 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  25.58 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  26.39 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  26.39 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  26.39 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  26.39 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  29.17 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  29.17 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  29.32 
 
 
484 aa  89.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  26.97 
 
 
270 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  28.88 
 
 
268 aa  89  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  28.95 
 
 
484 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  32.01 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  28.16 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  28.46 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  26.76 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  25.1 
 
 
273 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  30.57 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  27.41 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  26.79 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  26.59 
 
 
273 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  25.1 
 
 
274 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  31.01 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  23.66 
 
 
264 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  25.61 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  26.22 
 
 
270 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  26.74 
 
 
510 aa  85.5  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  26.52 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  24.71 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  24.71 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  28.27 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  24.71 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  24.71 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>