More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3192 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3192  hydroxymethylpyrimidine kinase  100 
 
 
319 aa  630  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394999  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3973  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  66.98 
 
 
310 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00627703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3580  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  53.42 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0582883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  53.42 
 
 
314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1134  putative phosphomethylpyrimidine kinase  57.41 
 
 
335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3356  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  56.23 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.417961  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0899  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  55.02 
 
 
318 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3023  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  50.85 
 
 
320 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1570  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  54.2 
 
 
318 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4628  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  55.44 
 
 
321 aa  295  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  44.12 
 
 
280 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 
291 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  38.87 
 
 
279 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  37.59 
 
 
281 aa  165  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3814  putative hydroxymethylpyrimidine kinase  37.91 
 
 
286 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00579021  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0865  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.63 
 
 
286 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00118659  normal  0.187037 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2000  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  37.82 
 
 
282 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3116  putative phosphomethylpyrimidine kinase  37.82 
 
 
282 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3174  hydroxymethylpyrimidine kinase  37.82 
 
 
282 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.262803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2743  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  37.82 
 
 
282 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.531156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1459  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  37.82 
 
 
282 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0913  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  37.82 
 
 
282 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1862  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  37.82 
 
 
282 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3152  putative phosphomethylpyrimidine kinase  37.82 
 
 
282 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  38.1 
 
 
269 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0379  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.05 
 
 
288 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0861  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.05 
 
 
288 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2527  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.05 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0489617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0832  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.05 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00416098  hitchhiker  0.0000421628 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0734  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.05 
 
 
288 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0751  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.05 
 
 
288 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.490476  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3959  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase-like  36.69 
 
 
288 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.112165 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2331  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.49 
 
 
286 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940899  normal  0.0456553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3686  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  39.19 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.532202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0829  putative phosphomethylpyrimidine kinase  31.05 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  32.83 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  32.83 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  32.14 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  32.45 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  32.71 
 
 
271 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  31.7 
 
 
265 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  32.2 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  31.2 
 
 
265 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  29.79 
 
 
285 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  30.8 
 
 
271 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  31.7 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  26.62 
 
 
269 aa  96.3  6e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  28.83 
 
 
270 aa  95.5  9e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  32.97 
 
 
277 aa  95.9  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  28.83 
 
 
270 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  28.83 
 
 
270 aa  94  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  31.36 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  31.07 
 
 
267 aa  92.8  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  31.12 
 
 
277 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  31.12 
 
 
277 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  30.15 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  24.9 
 
 
269 aa  87  4e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  27.5 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  27.68 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  28.43 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  29.8 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  32.54 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  26.88 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  29 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  28.62 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  27.44 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  30.52 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  27.57 
 
 
264 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  29.08 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  32.31 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  30.5 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  28.03 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  25.9 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  29.92 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  29.72 
 
 
271 aa  75.9  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03951  phosphomethylpyrimidine kinase  27.13 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.941064  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  29.89 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  24.65 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  31.35 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  26.1 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  30.71 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  27.61 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  27.61 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  27.61 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  28.11 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  29.5 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  27.61 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  23.19 
 
 
432 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  30.22 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  29.81 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  31.25 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03941  phosphomethylpyrimidine kinase  26.32 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  29.25 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  27.61 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  26.12 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  30.38 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0957  phosphomethylpyrimidine kinase  31.43 
 
 
269 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.297451  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  29.84 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>