More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0688 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
253 aa  512  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
281 aa  184  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  41.6 
 
 
290 aa  181  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  38.61 
 
 
291 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  41.04 
 
 
269 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  38.43 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  40.64 
 
 
265 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  39.38 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  41.13 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  39.68 
 
 
280 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  40.56 
 
 
271 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  38.84 
 
 
259 aa  154  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  40.24 
 
 
265 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  40.24 
 
 
265 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
265 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  40.64 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  37.9 
 
 
271 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  39.44 
 
 
271 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  39.44 
 
 
274 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  39.76 
 
 
265 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  41.04 
 
 
265 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  35.04 
 
 
260 aa  148  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  39.04 
 
 
265 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  35.63 
 
 
290 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3302  phosphomethylpyrimidine kinase  37.79 
 
 
276 aa  145  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  34.96 
 
 
267 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  38.14 
 
 
266 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  38.87 
 
 
266 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  35.34 
 
 
267 aa  142  4e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  38.4 
 
 
275 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  35.86 
 
 
268 aa  142  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  34.44 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  34.44 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  36.99 
 
 
285 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  36.95 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  34.5 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  36.25 
 
 
444 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  36.25 
 
 
450 aa  139  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  36 
 
 
267 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  36.8 
 
 
267 aa  138  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  39.29 
 
 
277 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  39.29 
 
 
277 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
269 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  36.03 
 
 
449 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  31.71 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  34.54 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  37.1 
 
 
266 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
281 aa  135  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  33.06 
 
 
436 aa  136  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  35.59 
 
 
490 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  32.13 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  35.4 
 
 
280 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  34.41 
 
 
449 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  32.66 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  36.13 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  30.2 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  35.25 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  35.59 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  30.8 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  34 
 
 
266 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  34 
 
 
266 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  34 
 
 
266 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  34 
 
 
266 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  37.13 
 
 
267 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  29.8 
 
 
267 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  34.32 
 
 
497 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  34 
 
 
266 aa  133  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 
267 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  34 
 
 
266 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 
267 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  32.4 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  35.66 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  34 
 
 
266 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  34 
 
 
266 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  35.08 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  34 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  38.14 
 
 
271 aa  131  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  37.12 
 
 
273 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  30.49 
 
 
272 aa  131  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  34.96 
 
 
273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  35.25 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  36.02 
 
 
304 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2484  phosphomethylpyrimidine kinase  35.37 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0082  phosphomethylpyrimidine kinase  38.43 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  36.02 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  34.75 
 
 
497 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0954  putative phosphomethylpyrimidine kinase  32.64 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0962  phosphomethylpyrimidine kinase  36.48 
 
 
382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.547391  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  32.91 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  36.8 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  37.55 
 
 
494 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>