More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0962 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0962  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
382 aa  765    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.547391  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0082  phosphomethylpyrimidine kinase  64.91 
 
 
267 aa  272  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0479  phosphomethylpyrimidine kinase  60.87 
 
 
249 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  50.91 
 
 
271 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
264 aa  199  9e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  53.26 
 
 
280 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
288 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
268 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 
266 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 
282 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 
268 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
266 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
263 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  48.12 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
268 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 
288 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 
288 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  46.97 
 
 
271 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  39.17 
 
 
436 aa  182  6e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 
260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  50.62 
 
 
259 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 
270 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 
265 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  53.08 
 
 
271 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  45.88 
 
 
264 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  51.29 
 
 
276 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 
270 aa  176  7e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  40.38 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  47.57 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
270 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 
268 aa  173  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
268 aa  173  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
263 aa  173  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  47.19 
 
 
484 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  45.49 
 
 
531 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
497 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  51.11 
 
 
290 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  42.45 
 
 
281 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
283 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
308 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  48.71 
 
 
303 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0818  phosphomethylpyrimidine kinase  49.17 
 
 
272 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0656179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
497 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  43.36 
 
 
262 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 
267 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 
293 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
264 aa  169  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  47.97 
 
 
303 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  39.26 
 
 
518 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07930  bifunctional enzyme, hydroxymethylpyrimidine kinase / phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 
279 aa  168  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0236651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 
267 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 
266 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 
264 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  48.71 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 
269 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  41.25 
 
 
270 aa  167  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 
264 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 
285 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 
272 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  37.78 
 
 
276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  40.86 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  37.78 
 
 
276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  40.86 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  41.48 
 
 
518 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  39.41 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 
304 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 
270 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  42.29 
 
 
267 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  39.61 
 
 
270 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  42.29 
 
 
267 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 
270 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 
284 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 
490 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  37.16 
 
 
273 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  41.9 
 
 
267 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 
494 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 
291 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 
270 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 
271 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  44.28 
 
 
283 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  43.19 
 
 
267 aa  160  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 
266 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  41.96 
 
 
267 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 
266 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  43.35 
 
 
267 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 
270 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 
270 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 
273 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 
270 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 
270 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 
270 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  41.5 
 
 
266 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 
266 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  41.31 
 
 
260 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 
266 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  41.9 
 
 
266 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 
266 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>