More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0479 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0479  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
249 aa  487  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0962  phosphomethylpyrimidine kinase  60.87 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.547391  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0082  phosphomethylpyrimidine kinase  59.7 
 
 
267 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 
288 aa  201  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 
271 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 
280 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
269 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  47.86 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 
518 aa  189  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
264 aa  187  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 
270 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
270 aa  185  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
283 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 
267 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  43.46 
 
 
281 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
494 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  46.54 
 
 
497 aa  178  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 
436 aa  176  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 
297 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  43.9 
 
 
270 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 
268 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0818  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
272 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0656179  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 
265 aa  176  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 
484 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 
269 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  48.22 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 
275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 
497 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 
282 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 
263 aa  172  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 
270 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 
270 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 
270 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 
270 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  43.09 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 
270 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 
270 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  40.7 
 
 
272 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
267 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  37.65 
 
 
269 aa  170  2e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
267 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 
270 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 
270 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
267 aa  169  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 
270 aa  168  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 
484 aa  168  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 
271 aa  168  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 
492 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  42.02 
 
 
266 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
275 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  40.98 
 
 
269 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  46.25 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  40.62 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07930  bifunctional enzyme, hydroxymethylpyrimidine kinase / phosphomethylpyrimidine kinase  47.46 
 
 
279 aa  166  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0236651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 
270 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 
271 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  48.25 
 
 
271 aa  165  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 
490 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  41.73 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  39.45 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 
267 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 
266 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  39.69 
 
 
277 aa  161  8.000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 
295 aa  161  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0817  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
275 aa  160  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.237614  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 
304 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  41.45 
 
 
531 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 
267 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  41.41 
 
 
267 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  39.69 
 
 
270 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
273 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>