More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2662 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
281 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  63.43 
 
 
279 aa  362  4e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  61.03 
 
 
291 aa  346  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  60.53 
 
 
280 aa  318  5e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  52.59 
 
 
269 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  48.07 
 
 
285 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3686  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  46.15 
 
 
294 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.532202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  45.9 
 
 
265 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3814  putative hydroxymethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 
286 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00579021  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
271 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 
265 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
265 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 
265 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 
277 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  46.01 
 
 
277 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 
265 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0832  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  44.32 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00416098  hitchhiker  0.0000421628 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0379  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  44.32 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0861  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  44.32 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3959  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase-like  44.53 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.112165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0734  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  43.96 
 
 
288 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0751  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  43.96 
 
 
288 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.490476  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  42.81 
 
 
290 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0865  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  45.13 
 
 
286 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00118659  normal  0.187037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 
265 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  43.46 
 
 
265 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2527  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  43.87 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0489617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 
271 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2743  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  44.07 
 
 
282 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.531156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3152  putative phosphomethylpyrimidine kinase  44.07 
 
 
282 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3116  putative phosphomethylpyrimidine kinase  44.07 
 
 
282 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1862  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  44.07 
 
 
282 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2000  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  44.07 
 
 
282 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3174  hydroxymethylpyrimidine kinase  44.07 
 
 
282 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.262803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1459  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  44.07 
 
 
282 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0913  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  44.07 
 
 
282 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
262 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2331  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  44.53 
 
 
286 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940899  normal  0.0456553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3356  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  41.9 
 
 
324 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.417961  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0829  putative phosphomethylpyrimidine kinase  37.41 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1134  putative phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 
335 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3023  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  40.38 
 
 
320 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.02 
 
 
314 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348209  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3580  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.02 
 
 
314 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0582883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1570  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  40 
 
 
318 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  40.78 
 
 
263 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  37.86 
 
 
270 aa  159  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  37.21 
 
 
260 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  36.19 
 
 
268 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  38.08 
 
 
267 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  39.53 
 
 
266 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0899  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.95 
 
 
318 aa  156  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  38.04 
 
 
266 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  38.24 
 
 
285 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0179  putative phosphomethylpyrimidine kinase  36.3 
 
 
264 aa  155  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00139306  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4628  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  40.82 
 
 
321 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  36.25 
 
 
268 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  36.25 
 
 
268 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3302  phosphomethylpyrimidine kinase  36.67 
 
 
276 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3192  hydroxymethylpyrimidine kinase  37.92 
 
 
319 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394999  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0167  phosphomethylpyrimidine kinase  36.67 
 
 
264 aa  149  6e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00133155  hitchhiker  0.000172032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  36.65 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  37.94 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  33.99 
 
 
267 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  32.41 
 
 
269 aa  146  3e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  35.83 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1533  phosphomethylpyrimidine kinase  38.37 
 
 
271 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  38.06 
 
 
275 aa  143  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  38.26 
 
 
270 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  33.86 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3973  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  33.58 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00627703 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  31.23 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  35.04 
 
 
272 aa  140  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  36.52 
 
 
268 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0424  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 
276 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  35.46 
 
 
257 aa  139  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  38.28 
 
 
273 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  37.26 
 
 
282 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  33.47 
 
 
281 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  37.26 
 
 
282 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  37.26 
 
 
282 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  36.57 
 
 
282 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  35.18 
 
 
260 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  34.6 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  34.63 
 
 
271 aa  135  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  34.31 
 
 
268 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  29.96 
 
 
432 aa  135  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  34.02 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  34.72 
 
 
269 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  35.83 
 
 
269 aa  135  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  31.44 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  33.86 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  31.58 
 
 
510 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34580  phosphomethylpyrimidine kinase  37.64 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  30.77 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>