More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3814 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3814  putative hydroxymethylpyrimidine kinase  100 
 
 
286 aa  577  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00579021  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0865  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  97.9 
 
 
286 aa  550  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00118659  normal  0.187037 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2331  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  91.61 
 
 
286 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940899  normal  0.0456553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0751  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  85.46 
 
 
288 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.490476  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0734  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  85.11 
 
 
288 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3959  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase-like  83.69 
 
 
288 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.112165 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0832  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  84.95 
 
 
288 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00416098  hitchhiker  0.0000421628 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0379  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  84.4 
 
 
288 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0861  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  84.4 
 
 
288 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2743  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  84.06 
 
 
282 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.531156  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2000  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  84.06 
 
 
282 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1862  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  84.06 
 
 
282 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3174  hydroxymethylpyrimidine kinase  84.06 
 
 
282 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.262803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1459  phosphomethylpyrimidine kinase ThiD, putative  84.06 
 
 
282 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3152  putative phosphomethylpyrimidine kinase  84.06 
 
 
282 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0913  putative phosphomethylpyrimidine kinase ThiD  84.06 
 
 
282 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3116  putative phosphomethylpyrimidine kinase  84.06 
 
 
282 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2527  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  85.82 
 
 
323 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0489617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  46.86 
 
 
279 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  45.32 
 
 
291 aa  235  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  47.97 
 
 
280 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 
281 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3686  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  45.14 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.532202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2419  Phosphomethylpyrimidine kinase  41.04 
 
 
269 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3580  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.7 
 
 
314 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0582883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.7 
 
 
314 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3973  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  39.63 
 
 
310 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00627703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3023  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.43 
 
 
320 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3192  hydroxymethylpyrimidine kinase  37.91 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394999  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3356  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.04 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.417961  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0899  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  40.07 
 
 
318 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1570  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.88 
 
 
318 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1134  putative phosphomethylpyrimidine kinase  37.22 
 
 
335 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1513  Phosphomethylpyrimidine kinase  35.29 
 
 
285 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0466134  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4628  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.12 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2903  Phosphomethylpyrimidine kinase  37.36 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0084405  hitchhiker  0.000491864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3305  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  37.36 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0104296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0829  putative phosphomethylpyrimidine kinase  31.11 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09280  phosphomethylpyrimidine kinase  34.09 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.52325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3772  phosphomethylpyrimidine kinase  32.57 
 
 
265 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0714273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12410  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  31.82 
 
 
290 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  33.72 
 
 
265 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4782  phosphomethylpyrimidine kinase  33.72 
 
 
265 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0384059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4836  phosphomethylpyrimidine kinase  32.95 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4340  phosphomethylpyrimidine kinase  31.8 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.994514  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1133  phosphomethylpyrimidine kinase  31.92 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0638  phosphomethylpyrimidine kinase  32.17 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4798  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  31.13 
 
 
265 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0393  phosphomethylpyrimidine kinase  33.08 
 
 
262 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.845054  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4945  phosphomethylpyrimidine kinase  31.78 
 
 
265 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0688  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
253 aa  105  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  31.46 
 
 
260 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  32.22 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  30.04 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  29.48 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  27.08 
 
 
267 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  28.35 
 
 
262 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  33.09 
 
 
266 aa  93.2  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  30.86 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  30.57 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  30.47 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  27.76 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  29.3 
 
 
268 aa  89.7  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  32.81 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  23.91 
 
 
264 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  29.63 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0441  phosphomethylpyrimidine kinase  27.69 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  30.5 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  28.84 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  28.98 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  28.89 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  28.74 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  31.16 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  33.06 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  25.97 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  28.2 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  27.27 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  29.41 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2484  phosphomethylpyrimidine kinase  28.24 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2054  phosphomethylpyrimidine kinase  30.34 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  28.78 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  28.28 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  28.69 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  30.61 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  29.04 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  27.87 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  27.87 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  27.87 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  27.87 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  29.03 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0361  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.27 
 
 
500 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  27.87 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  27.64 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  27.87 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  29.48 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  27.87 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  28.28 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  28.28 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  26.22 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>